More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  100 
 
 		 381 aa  757    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  58.31 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  50.43 
 
 		 353 aa  325  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  46.04 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  46.47 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  44.41 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.03 
 
 		 342 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.03 
 
 		 342 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  45.03 
 
 		 345 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  47.23 
 
 		 337 aa  279  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  45.4 
 
 		 350 aa  275  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.09 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  47.77 
 
 		 316 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  43.97 
 
 		 348 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.41 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  44.69 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  41.95 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  44.35 
 
 		 345 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  41.83 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  43.03 
 
 		 348 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  39.55 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.2 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.35 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  42.06 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.14 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.6 
 
 		 441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  38.69 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.44 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  37.97 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  38.89 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.41 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  38.44 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40.13 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  37.95 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  37.75 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40.24 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.16 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.09 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.36 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.07 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  31.25 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  30.84 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.93 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  31.74 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  31.44 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  31.44 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  31.44 
 
 		 340 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  31.44 
 
 		 340 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  29.71 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  29.41 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  42.14 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  33.07 
 
 		 358 aa  119  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.38 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  32.21 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  44.44 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  28.75 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  29.82 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  30.22 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  27.12 
 
 		 343 aa  96.3  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  31.73 
 
 		 336 aa  89.7  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  40 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  43.18 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  37.11 
 
 		 809 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  34.57 
 
 		 632 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  36.84 
 
 		 805 aa  52.8  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  37.76 
 
 		 859 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  32.98 
 
 		 810 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 837 aa  52.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  33.03 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  35.79 
 
 		 792 aa  52.8  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 783 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  38.16 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 807 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 799 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  30.85 
 
 		 579 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  33.65 
 
 		 815 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  33.68 
 
 		 803 aa  50.4  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  33.61 
 
 		 808 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 670 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.03 
 
 		 628 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  34.96 
 
 		 818 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.44 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  34.29 
 
 		 606 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 786 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  36.56 
 
 		 788 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  38.68 
 
 		 807 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  40.58 
 
 		 811 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  37.23 
 
 		 875 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.36 
 
 		 812 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  35.29 
 
 		 805 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  34.45 
 
 		 812 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  26.27 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 807 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 874 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  34.62 
 
 		 803 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  33.61 
 
 		 805 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  44.12 
 
 		 793 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  35.85 
 
 		 823 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  34.45 
 
 		 812 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  33.96 
 
 		 499 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>