140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0503 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  100 
 
 
443 aa  887    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  51.51 
 
 
432 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  53.2 
 
 
459 aa  434  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  44.78 
 
 
430 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  38.5 
 
 
441 aa  277  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  30.61 
 
 
598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  38.06 
 
 
607 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  36 
 
 
603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  34.92 
 
 
612 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  36.56 
 
 
623 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  30.42 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  36.47 
 
 
587 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  27.72 
 
 
512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  35.93 
 
 
616 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  30.27 
 
 
380 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  37.64 
 
 
518 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  30.41 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  23.58 
 
 
398 aa  92  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  27.11 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  23.05 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  34.36 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.32 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  33.74 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  25.08 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  32.52 
 
 
375 aa  67  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  25.33 
 
 
353 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  25 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  24.61 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  27.72 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.99 
 
 
383 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  25.3 
 
 
376 aa  60.5  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.52 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  23.74 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  30.19 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.33 
 
 
355 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  26.93 
 
 
355 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  22.07 
 
 
380 aa  56.6  0.0000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.48 
 
 
366 aa  56.6  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  21.88 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  26.77 
 
 
338 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.78 
 
 
383 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  31.62 
 
 
526 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.77 
 
 
372 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  41.1 
 
 
527 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  31.58 
 
 
388 aa  53.9  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  20.94 
 
 
337 aa  53.5  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  24.35 
 
 
388 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.3 
 
 
353 aa  53.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.32 
 
 
347 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  26.22 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  22.25 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  37.14 
 
 
373 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  25.08 
 
 
342 aa  50.8  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  30.94 
 
 
528 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  37.14 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.94 
 
 
345 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  24.54 
 
 
453 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  22.47 
 
 
452 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  24.22 
 
 
456 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  26.16 
 
 
351 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  24.22 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.25 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  38.57 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  26.07 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  25.44 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  26.74 
 
 
351 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  24.58 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  27.14 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.57 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  24.22 
 
 
456 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  34.29 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.21 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.92 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  24.61 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  23.44 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  23.44 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  23.2 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  21.05 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  21.23 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.29 
 
 
450 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  28.87 
 
 
509 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  22.57 
 
 
443 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  40.58 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.32 
 
 
355 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  26.85 
 
 
452 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 
384 aa  47.4  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  23.38 
 
 
341 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.26 
 
 
351 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  28.79 
 
 
340 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  21.99 
 
 
345 aa  47  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  29.63 
 
 
478 aa  46.6  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  26.61 
 
 
454 aa  46.6  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  22.97 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  22.97 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  22.97 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  37.18 
 
 
528 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.71 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.29 
 
 
354 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.28 
 
 
347 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.97 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>