141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3489 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  100 
 
 		 355 aa  707    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  48.17 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  48.17 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  48.17 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  47.28 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  47.85 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  45.56 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  42.69 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  43.02 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  43.1 
 
 		 338 aa  252  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  41.67 
 
 		 348 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  41.34 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.89 
 
 		 353 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.23 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.89 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  38.22 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  38.46 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.88 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  38.89 
 
 		 345 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.01 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  38.06 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.57 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  35.13 
 
 		 355 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  35.9 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  33.94 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.24 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  40 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  32.41 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35.69 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  34.34 
 
 		 373 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  34 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.58 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  34.34 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  35.11 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.63 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  32.36 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.35 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.54 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.83 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  30.3 
 
 		 340 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  29.95 
 
 		 340 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  30.03 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  30.03 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  30.03 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  30.03 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  30.03 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  29.23 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  28.96 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.33 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  37.55 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  48.65 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.72 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.13 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  28 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  27.48 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  29.24 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  31.82 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  36.18 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  31.61 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  25.32 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 772 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.48 
 
 		 628 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 670 aa  52.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 792 aa  52.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  32.98 
 
 		 579 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  33 
 
 		 558 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  35.42 
 
 		 652 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  37.29 
 
 		 774 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  35.58 
 
 		 805 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  34.78 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  38.81 
 
 		 632 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  29.9 
 
 		 650 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  36 
 
 		 537 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  48.48 
 
 		 854 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.88 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.09 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.09 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  36.67 
 
 		 571 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 840 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.73 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  28.89 
 
 		 462 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  38.54 
 
 		 768 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  29.2 
 
 		 457 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  30.43 
 
 		 648 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  33 
 
 		 803 aa  46.6  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  38.16 
 
 		 811 aa  46.6  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.86 
 
 		 462 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  35.79 
 
 		 790 aa  46.2  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  37.66 
 
 		 639 aa  46.2  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  35.56 
 
 		 791 aa  46.2  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  33.71 
 
 		 809 aa  46.2  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  30.86 
 
 		 462 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  32.63 
 
 		 791 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  39.39 
 
 		 776 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  32.26 
 
 		 570 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  39.39 
 
 		 776 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  32.63 
 
 		 791 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 800 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 800 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  33.7 
 
 		 619 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>