More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1914 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  89.2 
 
 		 457 aa  800    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  81.64 
 
 		 463 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  81.64 
 
 		 463 aa  703    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  73.88 
 
 		 461 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  81.86 
 
 		 463 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  73.93 
 
 		 462 aa  675    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  90.04 
 
 		 456 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  81.64 
 
 		 463 aa  703    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  90.26 
 
 		 456 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  81.64 
 
 		 463 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  80.99 
 
 		 463 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 462 aa  923    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  73.66 
 
 		 461 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  88.98 
 
 		 457 aa  799    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  81.86 
 
 		 463 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  99.78 
 
 		 462 aa  921    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  81.64 
 
 		 463 aa  715    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  88.98 
 
 		 457 aa  799    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  50.11 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  46.81 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  50.21 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  46.9 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.23 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  45.59 
 
 		 462 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  45.24 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  45.59 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  45.02 
 
 		 462 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.89 
 
 		 455 aa  356  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2688  peptidase RseP  46.58 
 
 		 458 aa  349  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.214721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1765  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.15 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1830  peptidase RseP  47.08 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.67 
 
 		 455 aa  341  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  44.35 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4941  membrane-associated zinc metalloprotease  44.95 
 
 		 456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.32 
 
 		 454 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  45.54 
 
 		 453 aa  335  7e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1230  membrane-associated zinc metalloprotease  48.6 
 
 		 454 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  41.67 
 
 		 454 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2578  peptidase RseP  48.17 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.041357  normal  0.0436564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1445  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.09 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  42.16 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  41.19 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.83 
 
 		 456 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.95 
 
 		 456 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.19 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  41.4 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  41.4 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.68 
 
 		 454 aa  324  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.53 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  40.26 
 
 		 454 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.13 
 
 		 450 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  42.92 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.99 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  43.13 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.08 
 
 		 456 aa  316  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.92 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  40.52 
 
 		 451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  41.13 
 
 		 491 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1995  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.55 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.3 
 
 		 450 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  41.42 
 
 		 450 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  39.61 
 
 		 452 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.68 
 
 		 456 aa  310  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  41.85 
 
 		 450 aa  310  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.79 
 
 		 461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  41.45 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.18 
 
 		 456 aa  306  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  44.6 
 
 		 417 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.24 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  38.99 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  42.27 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  38.64 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.92 
 
 		 456 aa  299  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  39.02 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  38.81 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.66 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  38.81 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  38.81 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  38.81 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  38.81 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.98 
 
 		 451 aa  296  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  38.58 
 
 		 451 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  39.53 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  38.59 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  38.58 
 
 		 451 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  38.59 
 
 		 450 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  38.36 
 
 		 451 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  38.59 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.92 
 
 		 450 aa  292  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  37.72 
 
 		 450 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  37.72 
 
 		 450 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  37.72 
 
 		 450 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  37.72 
 
 		 450 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.47 
 
 		 448 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  39.06 
 
 		 451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  37.37 
 
 		 450 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  38.49 
 
 		 451 aa  289  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  37.8 
 
 		 450 aa  287  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  38.84 
 
 		 451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  37.61 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>