278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4655 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 		 340 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  87.06 
 
 		 359 aa  615  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  72.51 
 
 		 342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  72.51 
 
 		 342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  72.22 
 
 		 345 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  67.06 
 
 		 340 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  46.76 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  47.41 
 
 		 353 aa  295  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  44.41 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  45.74 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.41 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  45.59 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  46.79 
 
 		 355 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  41.38 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  40.35 
 
 		 348 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.52 
 
 		 348 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  42.3 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  41 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.56 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  38.78 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.38 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  36.62 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  39.77 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  35.33 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35.22 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  34.65 
 
 		 395 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  37.43 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  35.74 
 
 		 357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  33.63 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  38.25 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.63 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  34.32 
 
 		 373 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.71 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.18 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  36.7 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  33 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.54 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.37 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.9 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.21 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  29.36 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  29.36 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  29.36 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  29.05 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  29.05 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  29.05 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  29.05 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  29.05 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  29.05 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.05 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.33 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  43.97 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  42.74 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  32.51 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  29.88 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  29.51 
 
 		 357 aa  95.9  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  33.17 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  32.96 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  34.91 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  25.43 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  32.79 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.23 
 
 		 628 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  35.87 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  37.5 
 
 		 558 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  34.04 
 
 		 652 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 788 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  31.15 
 
 		 570 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  33.33 
 
 		 650 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  43.66 
 
 		 802 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  37.37 
 
 		 575 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 815 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  30.77 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 802 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 783 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.11 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  33.04 
 
 		 571 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 786 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  36.84 
 
 		 790 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  33.33 
 
 		 639 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  28.44 
 
 		 670 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 799 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 793 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  28.87 
 
 		 537 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  34.85 
 
 		 632 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  40.3 
 
 		 655 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0798  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.33 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  36.19 
 
 		 802 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  36.23 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  42.42 
 
 		 815 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  39.13 
 
 		 812 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  40.91 
 
 		 801 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  32.76 
 
 		 566 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  36.56 
 
 		 818 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  30.23 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  37.88 
 
 		 775 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  31.91 
 
 		 808 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  47  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  31.78 
 
 		 809 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  30.11 
 
 		 810 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>