More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3020 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3020  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  37.74 
 
 		 466 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  42.22 
 
 		 503 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  40 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  32.09 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  37.86 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  38.2 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  37.78 
 
 		 452 aa  65.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  34.02 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  30.7 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  35.71 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  38.2 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  38.2 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  38.2 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  38.2 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  38.2 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  38.37 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  35.64 
 
 		 481 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  30.89 
 
 		 467 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  36.11 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  40.48 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  34.55 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  40.48 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  32.59 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  35.79 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  33.33 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  40 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  40 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  40 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  35.37 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  41.43 
 
 		 485 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  41.33 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0448  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.53 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  32.99 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  32.99 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  40.85 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  31.68 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  37.66 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  32.99 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  31.03 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  34.78 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  37.08 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  30.83 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.7 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  31.31 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  34.52 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  30.28 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  39.44 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  28.57 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  33.6 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  40 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.36 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.01 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  32.99 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  33.6 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  39.44 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  37.08 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  39.44 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  39.44 
 
 		 499 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  32.99 
 
 		 496 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.65 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.63 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  31.07 
 
 		 485 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  35.8 
 
 		 520 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  32.99 
 
 		 496 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  39.44 
 
 		 499 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  38.46 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  29.52 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  29.52 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  32.99 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  39.24 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  29.13 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  29.7 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  32.81 
 
 		 463 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.47 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  28.87 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  28.8 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  28.87 
 
 		 504 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  38.03 
 
 		 500 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  35.42 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  32.61 
 
 		 478 aa  55.8  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  32.65 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  40.28 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  31.68 
 
 		 473 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  31.37 
 
 		 471 aa  55.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40 
 
 		 502 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.87 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  32.67 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40 
 
 		 502 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  38.46 
 
 		 502 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  38.46 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  32.67 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>