More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0448 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0448  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 347 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  33.64 
 
 		 508 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  33.5 
 
 		 524 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  27.73 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  30.57 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  31.19 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  30.1 
 
 		 511 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  29.44 
 
 		 501 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  30.65 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  29.02 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  32.58 
 
 		 491 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  28.36 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  29.33 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  30.28 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  29.58 
 
 		 473 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  27.98 
 
 		 496 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  30.37 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  27.8 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  47.22 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  30.37 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  27.27 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  29.03 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  27.83 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  27.27 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  28.65 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  31.68 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  28.57 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  29.63 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  27.72 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  26.59 
 
 		 467 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  26.61 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  26.61 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  27.27 
 
 		 527 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  26.19 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  25.7 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  26.19 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  29.95 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  29.44 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  41.56 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  27.23 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  28.23 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  34.62 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  25.91 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  28.84 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  28.29 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  28.23 
 
 		 472 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  27.98 
 
 		 528 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  26.85 
 
 		 535 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  28.7 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  27.93 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  30.91 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  23 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  28.65 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  27.73 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  26.64 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  39.44 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  30.35 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  24.27 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  29.03 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  25.85 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3020  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.23 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  28.24 
 
 		 526 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  26.83 
 
 		 496 aa  59.3  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  35.85 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  23.85 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  26.51 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  45.59 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  23.58 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  24.27 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  30.77 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  25.88 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  47.69 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  26.84 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  35.35 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1495  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.33 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1278  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.71 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  25 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  26.03 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  28.16 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  29.81 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.98 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  28.57 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  37.66 
 
 		 623 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4674  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.44 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  43.24 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  39.73 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  40.96 
 
 		 528 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.78 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  24 
 
 		 472 aa  57  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  27.85 
 
 		 588 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.73 
 
 		 569 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  22.17 
 
 		 474 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  26.05 
 
 		 474 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  49.18 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  25.62 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  27.41 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.8 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  24.11 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4524  PDZ/DHR/GLGF  27.65 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>