More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1495 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1495  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
373 aa  707    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4090  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.1 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.51 
 
 
303 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1230  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.33 
 
 
303 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.181134  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.07 
 
 
301 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3073  PDZ/DHR/GLGF  28.29 
 
 
329 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.82446  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0856  PDZ/DHR/GLGF  36.88 
 
 
312 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0384143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.06 
 
 
312 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0913  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.75 
 
 
303 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000218264  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0905  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.38 
 
 
312 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.43 
 
 
385 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  29.21 
 
 
388 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  29.21 
 
 
402 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  29.21 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  29.21 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  29.21 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  30.1 
 
 
380 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  29.21 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  30.7 
 
 
383 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.79 
 
 
408 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  29.21 
 
 
387 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  29.13 
 
 
386 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  29.13 
 
 
386 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  29.77 
 
 
386 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  28.89 
 
 
388 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  28.34 
 
 
398 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  28.48 
 
 
402 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.25 
 
 
401 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  28.25 
 
 
401 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  29.45 
 
 
386 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  28.57 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.03 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  28.16 
 
 
386 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  31.01 
 
 
511 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  28.25 
 
 
404 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  28.25 
 
 
404 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.94 
 
 
401 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.94 
 
 
401 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  27.94 
 
 
401 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2880  periplasmic serine protease DegS  27.13 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0120636  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  27.39 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.39 
 
 
442 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  29.94 
 
 
513 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  27.76 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  28.25 
 
 
403 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  27.62 
 
 
403 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.25 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  30.03 
 
 
503 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  28.08 
 
 
471 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  27.62 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  30.03 
 
 
505 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  27.07 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  28.1 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.75 
 
 
417 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  27.62 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  29.93 
 
 
491 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0099  protease DegS  27.22 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  27.95 
 
 
456 aa  89.4  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  31.56 
 
 
397 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  25.83 
 
 
497 aa  89.4  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  27.51 
 
 
466 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  27.67 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2668  exported serine protease  25.97 
 
 
354 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00113896  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  29.07 
 
 
503 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0554  PDZ/DHR/GLGF  26.42 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00992555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  29.1 
 
 
523 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  28.39 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  28.83 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  28.06 
 
 
450 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.13 
 
 
390 aa  87  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  27.3 
 
 
473 aa  86.7  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  26.1 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  28.39 
 
 
389 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  25.32 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  26.1 
 
 
362 aa  86.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  28.48 
 
 
526 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  26.1 
 
 
362 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  25.4 
 
 
354 aa  86.3  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  28.03 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  28.39 
 
 
528 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  28.18 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  26.85 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  26.86 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  25.63 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  28.34 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  27.71 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.98 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  27.08 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  27.13 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  28.43 
 
 
476 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  27.48 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  27.42 
 
 
520 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  28.16 
 
 
506 aa  84.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  29.52 
 
 
489 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  25.16 
 
 
484 aa  84  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  28.38 
 
 
527 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  26.52 
 
 
475 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  25.24 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.71 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>