More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4524 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4524  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
348 aa  715    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  29.03 
 
 
476 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  25.93 
 
 
464 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  29.52 
 
 
485 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  28.64 
 
 
466 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  31.12 
 
 
461 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  30.17 
 
 
472 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.63 
 
 
457 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  31.19 
 
 
501 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  27.6 
 
 
479 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  31.22 
 
 
475 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  29.84 
 
 
464 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  30 
 
 
506 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  30.96 
 
 
503 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  29.72 
 
 
476 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  29.36 
 
 
506 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  29.36 
 
 
493 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  31.09 
 
 
511 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  30.13 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  30.32 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  29.63 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  24.05 
 
 
462 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  26.76 
 
 
492 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  26.34 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  34.2 
 
 
495 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  31.47 
 
 
545 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  30.41 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  29.36 
 
 
514 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  27.31 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  29.15 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  28.86 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  27.73 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  27.27 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  28.38 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  27.93 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  30.1 
 
 
504 aa  80.5  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  28.11 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  30.56 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  26.46 
 
 
460 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  27.55 
 
 
515 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  30.56 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  30.56 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  29.6 
 
 
482 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  29.36 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  30.53 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  28.37 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  31.05 
 
 
505 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  29.96 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  28.04 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  26.98 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  28.11 
 
 
449 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  28.31 
 
 
504 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  28.51 
 
 
524 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  27.23 
 
 
496 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  30.09 
 
 
450 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  30 
 
 
485 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  23.64 
 
 
478 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  29.17 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  29.17 
 
 
511 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  30.24 
 
 
511 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  30.57 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  28.9 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  26.04 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  28.9 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  28.9 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  27.54 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  27.35 
 
 
500 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  28.07 
 
 
498 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  27.72 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  26.79 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  29.36 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  28.64 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  28.64 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  28.64 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  27.15 
 
 
525 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  27.57 
 
 
497 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  24.41 
 
 
498 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  27.08 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  27.8 
 
 
501 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1346  protease Do  26.96 
 
 
494 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.62004  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  27.63 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  25.56 
 
 
459 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  27.63 
 
 
457 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  28.04 
 
 
474 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  27.63 
 
 
457 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  28.24 
 
 
481 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  27.65 
 
 
498 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  24.26 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  26.85 
 
 
477 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1646  serine protease, DO/DeqQ family  26.96 
 
 
494 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  26.46 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  29.77 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  28.24 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  27.54 
 
 
471 aa  72  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  26.91 
 
 
502 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  26.43 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  27.65 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  28.83 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  27.75 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  29.46 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>