44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1873 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1873  secreted protein containing a PDZ domain  100 
 
 		 340 aa  632  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  25.89 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  22.5 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  22.5 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  22.5 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  21.47 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  22.5 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  21.47 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  22.5 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  22.5 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.68 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  22.5 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  29.57 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  27.1 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  22.91 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  28.46 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  25.71 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  27.99 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.77 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.11 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.96 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.52 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.32 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  28.8 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  26.6 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.76 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.44 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  25 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  23.08 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  20.44 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  26.32 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  28.15 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  26.29 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  26.89 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  20.57 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  25.86 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  24.28 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 797 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  23.78 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  35.24 
 
 		 837 aa  43.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  35 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  24.42 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  23.66 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>