More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1400 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  88.94 
 
 		 443 aa  798    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  100 
 
 		 443 aa  883    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  54.81 
 
 		 442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  53.56 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  51.79 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  48.75 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  51.91 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  48.42 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  48.65 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  48.97 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  47.97 
 
 		 442 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  46.54 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  43.41 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  48.02 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  42.92 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  42.64 
 
 		 450 aa  341  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  41.94 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  43.32 
 
 		 454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  48.71 
 
 		 438 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  32.77 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  35.35 
 
 		 408 aa  232  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  35.25 
 
 		 412 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  34.59 
 
 		 412 aa  222  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  34.83 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  34.3 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  34.95 
 
 		 416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  34.73 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  35.86 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  34.55 
 
 		 403 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  32.82 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  35.16 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  32.89 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  32.89 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  32.89 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  32.32 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  31.91 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  35.44 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  28.51 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.9 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.81 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.84 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  29.17 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  28.94 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.65 
 
 		 355 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  28.57 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.1 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  27.08 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.82 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  28.24 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  29.29 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.13 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  28.1 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.63 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  28.27 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  25.58 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.7 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  27.04 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  25.8 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  23.98 
 
 		 442 aa  110  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  30.79 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.11 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  29.47 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  26.57 
 
 		 355 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.47 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  32.42 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  25.11 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  30.26 
 
 		 351 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.83 
 
 		 345 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.3 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.03 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  29.3 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  22.89 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  27.14 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  24.77 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  32.24 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  28.11 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.84 
 
 		 561 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  32.24 
 
 		 561 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  26.57 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.63 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  30.26 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  26.2 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  28.51 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.91 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.86 
 
 		 457 aa  100  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3363  peptidase M50  29.67 
 
 		 681 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25912  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.95 
 
 		 350 aa  99.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  22.59 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  26.06 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.34 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  26.29 
 
 		 383 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.46 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  23.53 
 
 		 370 aa  98.2  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  28.83 
 
 		 386 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.65 
 
 		 335 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  26.68 
 
 		 386 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  24.32 
 
 		 356 aa  97.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  24.06 
 
 		 369 aa  97.4  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  24.3 
 
 		 336 aa  97.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  28.35 
 
 		 386 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>