More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3203 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  100 
 
 		 453 aa  906    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  47.56 
 
 		 434 aa  392  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  44.99 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  42.95 
 
 		 442 aa  362  6e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  45.5 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  43.41 
 
 		 443 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  42.79 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  43.58 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  43.72 
 
 		 438 aa  328  9e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  42.36 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  39.39 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  40.94 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  39.32 
 
 		 451 aa  303  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  38.61 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  40.87 
 
 		 442 aa  296  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  39.66 
 
 		 447 aa  293  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  36.65 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  39.83 
 
 		 416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  36.76 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  38.06 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  37.88 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  41.31 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  34.12 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  36.07 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  33.26 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  33.41 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  33.26 
 
 		 412 aa  209  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  34.87 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  35.62 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  32.9 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  32.9 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  32.9 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  32.69 
 
 		 408 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  34.3 
 
 		 393 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  38.13 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  31.85 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  31.26 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.93 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  27.46 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  27.78 
 
 		 356 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  27.75 
 
 		 354 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  26.95 
 
 		 354 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  26.38 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.92 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  25.47 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.7 
 
 		 366 aa  111  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.52 
 
 		 357 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  26.78 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  27.53 
 
 		 355 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.14 
 
 		 367 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  27.65 
 
 		 352 aa  107  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  27.15 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.45 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.45 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  26.95 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  24.31 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  25.5 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.86 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  26.42 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  24.5 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  26.55 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  25.92 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  25.92 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  25.65 
 
 		 347 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.21 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  24.28 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.92 
 
 		 385 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  25.77 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.65 
 
 		 380 aa  97.4  5e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  24.94 
 
 		 377 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  30.77 
 
 		 438 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  27.87 
 
 		 469 aa  97.1  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.47 
 
 		 558 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.84 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  29.82 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  24.82 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.38 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.27 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.88 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  25.85 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  24.33 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  30.22 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  27.24 
 
 		 549 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.46 
 
 		 351 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  25.55 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  27.05 
 
 		 561 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.05 
 
 		 561 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.54 
 
 		 418 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  25.98 
 
 		 351 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.18 
 
 		 377 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  27.05 
 
 		 561 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.21 
 
 		 450 aa  93.2  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  26.41 
 
 		 341 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  26.17 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.23 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.89 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  24.49 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>