More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3624 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  100 
 
 
451 aa  905    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  60.67 
 
 
450 aa  547  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  44.8 
 
 
439 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  42.86 
 
 
440 aa  359  5e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  44.15 
 
 
434 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  40.93 
 
 
431 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  41.94 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  41.72 
 
 
443 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  40.31 
 
 
447 aa  318  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  43.54 
 
 
439 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  42.04 
 
 
438 aa  316  6e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  38.38 
 
 
442 aa  312  9e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  42.44 
 
 
438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  40.62 
 
 
442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  39.79 
 
 
454 aa  305  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  39.87 
 
 
455 aa  302  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  39.08 
 
 
453 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  40.96 
 
 
432 aa  293  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  42.24 
 
 
438 aa  247  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  32.91 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  35.96 
 
 
404 aa  234  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  34.67 
 
 
403 aa  232  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  33.33 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  34.64 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  34.64 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  34.64 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  31.67 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  33.62 
 
 
402 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  32.84 
 
 
412 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  33.41 
 
 
416 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  33.92 
 
 
394 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  32.31 
 
 
416 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  33.55 
 
 
393 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  33.19 
 
 
412 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  30.2 
 
 
413 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  35.09 
 
 
397 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  30.63 
 
 
413 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.58 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  29.72 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  28.7 
 
 
347 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.57 
 
 
355 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  28.34 
 
 
376 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  31.17 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  29.95 
 
 
428 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.19 
 
 
357 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.72 
 
 
561 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.38 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  37.88 
 
 
561 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  37.88 
 
 
561 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  29.55 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  28.98 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  26.71 
 
 
446 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  33.62 
 
 
355 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.44 
 
 
558 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.84 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.27 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.95 
 
 
428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  28.94 
 
 
354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  28.34 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.95 
 
 
428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  28.47 
 
 
363 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.74 
 
 
372 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.26 
 
 
451 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.94 
 
 
367 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  27.95 
 
 
337 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  27.02 
 
 
356 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  29.19 
 
 
354 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.64 
 
 
450 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  28.34 
 
 
438 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  26.84 
 
 
367 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.72 
 
 
420 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  24.72 
 
 
420 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  24.72 
 
 
420 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.93 
 
 
450 aa  99.8  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  29.23 
 
 
353 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.88 
 
 
355 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.49 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  30.22 
 
 
469 aa  99.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  27.37 
 
 
354 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.06 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.49 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  25.83 
 
 
422 aa  99  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.32 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  25.54 
 
 
370 aa  99  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.63 
 
 
343 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.44 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  25.11 
 
 
418 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.49 
 
 
418 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.23 
 
 
418 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  33.04 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.15 
 
 
446 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1818  peptidase M50  28.94 
 
 
371 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171111  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.36 
 
 
428 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.04 
 
 
379 aa  96.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  23.93 
 
 
352 aa  96.7  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  28.6 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.91 
 
 
347 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  28.87 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>