More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1351 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  100 
 
 		 416 aa  837    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  94.47 
 
 		 416 aa  790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  51.14 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  50.96 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  47.14 
 
 		 403 aa  352  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  46.9 
 
 		 412 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  47.16 
 
 		 412 aa  342  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  44.31 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  44.95 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  44.02 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  44.02 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  44.02 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  42.79 
 
 		 412 aa  289  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  37.58 
 
 		 431 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  37.66 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  37.78 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  38.17 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  37.34 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  36.04 
 
 		 442 aa  242  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  39.67 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  40.19 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  35.79 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  36.07 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  34.95 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  34.93 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  37.56 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  36.32 
 
 		 455 aa  226  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  33.41 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  37.82 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  33.19 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  35.2 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  33.99 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  37.38 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  33.19 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.57 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  33.64 
 
 		 432 aa  172  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  32.65 
 
 		 438 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  31.65 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.81 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.01 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.48 
 
 		 351 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  29.64 
 
 		 356 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  30.37 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  29.69 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  29.77 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  29.77 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.81 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  27.7 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  29.69 
 
 		 354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.1 
 
 		 347 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.87 
 
 		 357 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  28.5 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.01 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  30.66 
 
 		 353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.26 
 
 		 335 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2406  membrane-associated zinc metalloprotease  29.77 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  29.77 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  26.39 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1363  membrane-associated zinc metalloprotease  31.84 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  27.09 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  36.22 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  26.53 
 
 		 466 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.3 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  34.59 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  34.04 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.05 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.21 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  29.31 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  24.83 
 
 		 452 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.98 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  28.26 
 
 		 362 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.71 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.27 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  28.29 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.16 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.48 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  30.57 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12605  predicted protein  27.45 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627411  normal  0.0535145 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  27.76 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  24.71 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  31 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.6 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3268  hypothetical protein  28.14 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.65 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  24.34 
 
 		 448 aa  102  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  27.51 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12761  membrane-associated Zn-dependent protease 1  26.84 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0131503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  29.22 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  47.12 
 
 		 438 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  26.89 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  28 
 
 		 379 aa  99.8  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  33.5 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  27.32 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  24.69 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.94 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  24.75 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  26.15 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.22 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.49 
 
 		 558 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  24.94 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>