More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12885 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  100 
 
 		 404 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  73.53 
 
 		 404 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  73.53 
 
 		 404 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  73.53 
 
 		 404 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  65.53 
 
 		 412 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  65.05 
 
 		 412 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  50.12 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  48.2 
 
 		 412 aa  352  5.9999999999999994e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  48.16 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  46.19 
 
 		 403 aa  339  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  44.95 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  38.57 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  43.75 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  43.45 
 
 		 393 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  42.23 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  35.96 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  34.3 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  34.1 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  34.45 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  34.61 
 
 		 434 aa  212  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  34.28 
 
 		 453 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  33.7 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  35.19 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  33.93 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  34.01 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  33.97 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  34.82 
 
 		 440 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  35.1 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  40.59 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  32.87 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  33.33 
 
 		 454 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  32.21 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  32.02 
 
 		 447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  34.61 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.88 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  32.79 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  35.35 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.41 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.53 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.03 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  29.57 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  30.21 
 
 		 351 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  30.21 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.32 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  28.99 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.37 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.94 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  28.85 
 
 		 348 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.34 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  27.69 
 
 		 466 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  28.85 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.86 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  26.63 
 
 		 355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  32.9 
 
 		 469 aa  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  30.32 
 
 		 342 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.61 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28 
 
 		 343 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  27.09 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  26.84 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.72 
 
 		 561 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  28.83 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  28.65 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  28.53 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  30.4 
 
 		 367 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  24.86 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  32.95 
 
 		 561 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  26.26 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  32.95 
 
 		 561 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.12 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  30.57 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  25.18 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  33.95 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  26.82 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  34.16 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  25.75 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.26 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  30.77 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  33.05 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.19 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  25.69 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  27.1 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  27.64 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  25.87 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  27.81 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.5 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  26.65 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  27.27 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.5 
 
 		 456 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  29.44 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1818  peptidase M50  26.65 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.73 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  35.38 
 
 		 452 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  28.85 
 
 		 438 aa  96.3  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  31.31 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  26.06 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  24.88 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.23 
 
 		 450 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.69 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 		 495 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>