More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5120 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  100 
 
 
428 aa  874    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  51.14 
 
 
416 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  50.68 
 
 
416 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  49.31 
 
 
402 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  40.64 
 
 
412 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  40.64 
 
 
412 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  41.11 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  41.8 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  41.32 
 
 
404 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  41.32 
 
 
404 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  41.32 
 
 
404 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  38.57 
 
 
404 aa  289  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  33.41 
 
 
434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  34.95 
 
 
431 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  38.67 
 
 
412 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  33.97 
 
 
443 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  36.55 
 
 
453 aa  256  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  32.77 
 
 
443 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  35.67 
 
 
454 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  38.44 
 
 
413 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  32.91 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  33.9 
 
 
450 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  35.44 
 
 
440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  37.1 
 
 
394 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  31 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  33.48 
 
 
439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  36.09 
 
 
393 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.95 
 
 
455 aa  227  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  31.28 
 
 
442 aa  224  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  34.56 
 
 
439 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  32.19 
 
 
442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  34.57 
 
 
413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  30.77 
 
 
447 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  30 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  35.33 
 
 
397 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  30.7 
 
 
432 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  31.46 
 
 
438 aa  156  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  30.26 
 
 
428 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  30.65 
 
 
363 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.28 
 
 
345 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  27.17 
 
 
354 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  25.84 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  27.03 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.01 
 
 
451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.98 
 
 
339 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  34.96 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  38.29 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  28.27 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  25.56 
 
 
347 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  25.67 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  56.99 
 
 
438 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  26.04 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.43 
 
 
561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  29.43 
 
 
561 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.62 
 
 
351 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  29.32 
 
 
561 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  25.06 
 
 
354 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  27.87 
 
 
354 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  33.74 
 
 
453 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  25.17 
 
 
450 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  26.07 
 
 
442 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  25.55 
 
 
355 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.82 
 
 
347 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  27.63 
 
 
354 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
347 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  27.62 
 
 
351 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.37 
 
 
558 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
355 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  25.83 
 
 
383 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  27.04 
 
 
447 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  24.07 
 
 
453 aa  106  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  24.6 
 
 
438 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  27.62 
 
 
351 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12605  predicted protein  24.33 
 
 
370 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627411  normal  0.0535145 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.87 
 
 
354 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  25.19 
 
 
360 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  23.98 
 
 
453 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  24.66 
 
 
454 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.86 
 
 
446 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  33.48 
 
 
453 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  26.24 
 
 
376 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.89 
 
 
367 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  25.28 
 
 
450 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  25.77 
 
 
367 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.85 
 
 
335 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  27.05 
 
 
353 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3268  hypothetical protein  25.64 
 
 
364 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  25.06 
 
 
450 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  25.06 
 
 
450 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  25.06 
 
 
450 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  25.06 
 
 
450 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.54 
 
 
454 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  24.81 
 
 
388 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  25.42 
 
 
364 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  25.06 
 
 
450 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  26.27 
 
 
384 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.8 
 
 
450 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  25.33 
 
 
375 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  26.43 
 
 
364 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29.81 
 
 
438 aa  99.8  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>