More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2995 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  100 
 
 		 430 aa  866    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  54.04 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  52.07 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  47.34 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  45.89 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  44.04 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  42.56 
 
 		 447 aa  342  8e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  42.33 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  40.71 
 
 		 440 aa  318  7.999999999999999e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.62 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  36.58 
 
 		 469 aa  289  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  34.83 
 
 		 453 aa  246  8e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  35.41 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  34.15 
 
 		 453 aa  242  9e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.56 
 
 		 453 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.48 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  34.4 
 
 		 446 aa  230  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  34.16 
 
 		 453 aa  216  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  30.51 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  31.99 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.52 
 
 		 441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.58 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  29.23 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.86 
 
 		 449 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.99 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  29.36 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.02 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  29.42 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  28.25 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  30.09 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  27.56 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  28.78 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.06 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.39 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  31.06 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  28.45 
 
 		 463 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.94 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.33 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  28.04 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  30.29 
 
 		 452 aa  152  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.47 
 
 		 456 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  28.32 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  27.14 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.21 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.45 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.48 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  28.09 
 
 		 456 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  28.04 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  30.58 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.7 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.21 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.49 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.29 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.73 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.45 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.59 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.79 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  28.89 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.39 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  29.91 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.33 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.4 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  26.87 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  27.69 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  30.49 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  27.47 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  27.91 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.15 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  27.51 
 
 		 454 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.03 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  27.84 
 
 		 448 aa  140  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  29.52 
 
 		 451 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  27.47 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.65 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  28.19 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  28 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.3 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  28.51 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  26.32 
 
 		 463 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  28.7 
 
 		 443 aa  136  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  28.1 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  27.12 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  27.89 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  26.84 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  26.61 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  26.93 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  27.29 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.86 
 
 		 461 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  26.35 
 
 		 488 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.13 
 
 		 462 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.85 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  27.13 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  26.26 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  26.69 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  27.49 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  28.19 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.15 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.3 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.38 
 
 		 456 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>