More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1589 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
375 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  90.64 
 
 
377 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  67.66 
 
 
373 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  67.05 
 
 
374 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  55.31 
 
 
385 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  51.93 
 
 
383 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  52.21 
 
 
383 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  50.83 
 
 
383 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  50 
 
 
383 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  48.81 
 
 
383 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.66 
 
 
392 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  50.14 
 
 
383 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  53.31 
 
 
383 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  49.18 
 
 
379 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  51.52 
 
 
386 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  51.52 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  50.7 
 
 
386 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  51.52 
 
 
386 aa  354  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  50.68 
 
 
379 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  50.14 
 
 
386 aa  349  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  50.68 
 
 
379 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  49.72 
 
 
381 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  49.05 
 
 
379 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  45.75 
 
 
367 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  50.14 
 
 
384 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  44.97 
 
 
381 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.22 
 
 
377 aa  292  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  40.98 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.72 
 
 
361 aa  278  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.89 
 
 
372 aa  273  3e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.96 
 
 
366 aa  269  7e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  35.99 
 
 
380 aa  267  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.89 
 
 
355 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.62 
 
 
380 aa  259  8e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.2 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  38.25 
 
 
367 aa  252  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  39.61 
 
 
369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.6 
 
 
353 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  34.23 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  36.64 
 
 
356 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.71 
 
 
339 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  35 
 
 
354 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  34.51 
 
 
347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  34.35 
 
 
355 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  34.44 
 
 
354 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.18 
 
 
355 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  35.73 
 
 
354 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.8 
 
 
355 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  34.16 
 
 
354 aa  209  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  34.02 
 
 
450 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.74 
 
 
354 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.97 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  31.49 
 
 
338 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.42 
 
 
347 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.08 
 
 
368 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.66 
 
 
424 aa  189  9e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  32.23 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  32.79 
 
 
352 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.3 
 
 
480 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.35 
 
 
372 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.97 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  34.44 
 
 
341 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  33.14 
 
 
353 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  32.03 
 
 
369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  31.52 
 
 
370 aa  180  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.74 
 
 
441 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.51 
 
 
368 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.41 
 
 
368 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  34.79 
 
 
360 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.61 
 
 
343 aa  175  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  30.4 
 
 
377 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  36.76 
 
 
417 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  27.23 
 
 
417 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.71 
 
 
444 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  31.9 
 
 
396 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  28.69 
 
 
370 aa  168  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  30.52 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.61 
 
 
350 aa  167  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.97 
 
 
444 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.36 
 
 
444 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.3 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  39.11 
 
 
494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.28 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.81 
 
 
351 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  41.26 
 
 
443 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.12 
 
 
347 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.8 
 
 
455 aa  159  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30 
 
 
335 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  32.63 
 
 
388 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  34.07 
 
 
419 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  34.25 
 
 
351 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  38.03 
 
 
450 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  33.7 
 
 
351 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.27 
 
 
420 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  35.27 
 
 
420 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  35.27 
 
 
420 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.27 
 
 
418 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  27.98 
 
 
420 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.27 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  35.27 
 
 
420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>