More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  100 
 
 
438 aa  859    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  60.82 
 
 
438 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  52.26 
 
 
447 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  51.81 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  51.46 
 
 
442 aa  408  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  48.97 
 
 
443 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  47.15 
 
 
443 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  58.55 
 
 
438 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  51.48 
 
 
439 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  47.19 
 
 
434 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  44.44 
 
 
431 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  51.53 
 
 
432 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  44.87 
 
 
450 aa  347  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  44.69 
 
 
455 aa  345  8.999999999999999e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  42.44 
 
 
451 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  40.99 
 
 
453 aa  319  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  42.99 
 
 
439 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  41.85 
 
 
454 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  41.07 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  35.44 
 
 
394 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  36.85 
 
 
393 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  30 
 
 
428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  33.7 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  33.26 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  32.81 
 
 
403 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  33.11 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  32.21 
 
 
404 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  32.29 
 
 
402 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  32.82 
 
 
404 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  32.82 
 
 
404 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  32.82 
 
 
404 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  32.38 
 
 
416 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  31.57 
 
 
416 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  29.93 
 
 
413 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  34.21 
 
 
397 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  31.3 
 
 
413 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  30.65 
 
 
412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  28.22 
 
 
428 aa  133  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.46 
 
 
357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.53 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.19 
 
 
355 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.42 
 
 
343 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.32 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.18 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.66 
 
 
347 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.23 
 
 
339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  29.97 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  28.29 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  26.97 
 
 
352 aa  117  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  26.7 
 
 
376 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 
355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  27.92 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 
354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.83 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  27.56 
 
 
354 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  25.24 
 
 
370 aa  111  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  28.26 
 
 
379 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  24.49 
 
 
439 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  24.94 
 
 
370 aa  107  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 
353 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  25.31 
 
 
348 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  28.31 
 
 
355 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  28.5 
 
 
354 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  28.09 
 
 
341 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.51 
 
 
350 aa  106  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.01 
 
 
368 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.42 
 
 
354 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.4 
 
 
368 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.19 
 
 
372 aa  103  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  26.84 
 
 
446 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  28.05 
 
 
373 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.28 
 
 
428 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  25.78 
 
 
369 aa  103  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.28 
 
 
428 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  28.01 
 
 
363 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.25 
 
 
332 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.75 
 
 
446 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.19 
 
 
418 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 
420 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 
420 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.77 
 
 
351 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  25.38 
 
 
356 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 
420 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29.26 
 
 
438 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  28.32 
 
 
388 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 
420 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  26.4 
 
 
338 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.68 
 
 
418 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.8 
 
 
347 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  25.9 
 
 
370 aa  99.8  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  32.07 
 
 
438 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.33 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  26.82 
 
 
377 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  21.53 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.45 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  26.67 
 
 
369 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  26.32 
 
 
469 aa  97.8  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  21.76 
 
 
380 aa  97.4  5e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  23.08 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>