More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0120 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  67.55 
 
 		 453 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 453 aa  919    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  76.6 
 
 		 453 aa  711    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  65.35 
 
 		 446 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  64.02 
 
 		 453 aa  614  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  64.1 
 
 		 454 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  63.03 
 
 		 453 aa  589  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  41.58 
 
 		 469 aa  354  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  37 
 
 		 444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  35.9 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  35.75 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  36.7 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  34.83 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  34.73 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  34.61 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  29.93 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.26 
 
 		 439 aa  219  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  33.64 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  33.06 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.06 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.33 
 
 		 448 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.4 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  29.83 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  32.5 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  32.48 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  31.15 
 
 		 450 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.05 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  31.14 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.5 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  30.15 
 
 		 438 aa  193  4e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  30.23 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.61 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.21 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.79 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  31.32 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  30.97 
 
 		 454 aa  190  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  28.85 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.17 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  30.79 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.65 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  31.14 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.5 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  30.43 
 
 		 469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  30.94 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  30.57 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  29.39 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.62 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  27.7 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.47 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  30.9 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.98 
 
 		 456 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.04 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.21 
 
 		 480 aa  176  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.14 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  28.34 
 
 		 456 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  30.56 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  27.39 
 
 		 454 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  30.74 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  31.2 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.43 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.11 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.77 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  29.75 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.74 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  30.1 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.51 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  31.74 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.74 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  31.74 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  31.74 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  28.24 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.94 
 
 		 458 aa  171  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  31.5 
 
 		 461 aa  169  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  30.8 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  30.8 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  30.8 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  30.8 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  30.8 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  32.3 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  30.8 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  30.2 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  29.58 
 
 		 491 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  29.27 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.75 
 
 		 446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.16 
 
 		 461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  30.59 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  28.12 
 
 		 456 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.83 
 
 		 456 aa  166  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.81 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  30.15 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.31 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.04 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  30.37 
 
 		 450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.04 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  30.04 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.05 
 
 		 463 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.01 
 
 		 463 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  28.48 
 
 		 451 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.63 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>