More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1561 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  71.71 
 
 		 456 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  72.15 
 
 		 456 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  68.76 
 
 		 461 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  67.76 
 
 		 453 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  71.93 
 
 		 456 aa  688    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  70.07 
 
 		 461 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 		 456 aa  921    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  71.49 
 
 		 456 aa  685    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  69.08 
 
 		 456 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  71.71 
 
 		 456 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  71.71 
 
 		 456 aa  692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  72.81 
 
 		 456 aa  697    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  71.05 
 
 		 456 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  71.71 
 
 		 456 aa  674    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  69.74 
 
 		 456 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  72.15 
 
 		 456 aa  693    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  58.39 
 
 		 452 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  52.85 
 
 		 452 aa  495  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  51.32 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  52.85 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  53.51 
 
 		 451 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  53.07 
 
 		 451 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  52.63 
 
 		 452 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  52.85 
 
 		 451 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  53.83 
 
 		 450 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  52.63 
 
 		 450 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  53.07 
 
 		 451 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  53.29 
 
 		 451 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  50 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  53.29 
 
 		 451 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  51.1 
 
 		 451 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  51.1 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  51.1 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  51.1 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  51.1 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  50.66 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  50.66 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  50.66 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  50.88 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  50.66 
 
 		 450 aa  463  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  50.66 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  51.1 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  50.44 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  51.97 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  50.44 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  50.22 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  49.34 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  45.93 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.83 
 
 		 448 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.24 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  44.04 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.49 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.14 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  43.4 
 
 		 450 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.18 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  43.18 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  43.15 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.79 
 
 		 455 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  42.26 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  42.25 
 
 		 450 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  43.37 
 
 		 450 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.37 
 
 		 450 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  41.27 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  43.04 
 
 		 454 aa  346  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.04 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  42.01 
 
 		 453 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.11 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  37.66 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  40.41 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.9 
 
 		 455 aa  330  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  40.22 
 
 		 454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.35 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  41.36 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.29 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  39.73 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.13 
 
 		 454 aa  315  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  39.73 
 
 		 475 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  41.44 
 
 		 461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  38.36 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  40.72 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  39.42 
 
 		 466 aa  300  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.13 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  39.92 
 
 		 462 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  39.27 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  39.27 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.98 
 
 		 463 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.98 
 
 		 463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.98 
 
 		 463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  36.63 
 
 		 469 aa  286  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  38.69 
 
 		 462 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.77 
 
 		 463 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.77 
 
 		 463 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.77 
 
 		 463 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.77 
 
 		 463 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.37 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.77 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  37.37 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.17 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.1 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.1 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>