More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1961 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 469 aa  931    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  41.58 
 
 		 453 aa  354  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  39.07 
 
 		 453 aa  347  4e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  40.89 
 
 		 453 aa  342  7e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.7 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.79 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  37.61 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  38.89 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  36.48 
 
 		 438 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  37.25 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  36.19 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  36.58 
 
 		 430 aa  277  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  34.84 
 
 		 444 aa  259  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  36.03 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  36.56 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  31.64 
 
 		 447 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  34.92 
 
 		 442 aa  236  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.77 
 
 		 439 aa  226  8e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.31 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  31.94 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  34.61 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  32.22 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.47 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  32.08 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.95 
 
 		 455 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  33.9 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.65 
 
 		 450 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  32.43 
 
 		 450 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.71 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.1 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.51 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  31.73 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  34.83 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  33.27 
 
 		 454 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.83 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  32.02 
 
 		 448 aa  193  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.37 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.88 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  32.51 
 
 		 450 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  32.31 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  33.13 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  31.56 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  31.55 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.31 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.86 
 
 		 480 aa  186  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.24 
 
 		 462 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  30.24 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  31.62 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  32.24 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  31.02 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.24 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  33.81 
 
 		 454 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  31.76 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.59 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  30.69 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.1 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.39 
 
 		 456 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  29.81 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  31.15 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  31.03 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  30.82 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.82 
 
 		 463 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.67 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.04 
 
 		 454 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.6 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.12 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.87 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.82 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.82 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.31 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.68 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  28.78 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.82 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.82 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.82 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.82 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.99 
 
 		 456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  28.27 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.77 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  30.77 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.77 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  31.17 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.19 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  28.07 
 
 		 454 aa  163  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.98 
 
 		 456 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.72 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.69 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  27.61 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.89 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  26.44 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  28.69 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.65 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.27 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  30.53 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  28.84 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.53 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  29.01 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  27.86 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  28.23 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>