More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0383 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  100 
 
 		 439 aa  889    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  46.28 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  41.88 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  40.77 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  42.76 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  38.24 
 
 		 444 aa  305  9.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  38.62 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  36.28 
 
 		 438 aa  262  8e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  35.45 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  34.32 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  35.48 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.98 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  33.77 
 
 		 469 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  35.34 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  33.92 
 
 		 446 aa  222  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  32.97 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  33.26 
 
 		 453 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.05 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  27.85 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.77 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  31 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  29.61 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  28.85 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  29.61 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.17 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  27.99 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  29.06 
 
 		 456 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  28.76 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.29 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  29.29 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.4 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.99 
 
 		 463 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.99 
 
 		 463 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.99 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.99 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  29.71 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.99 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.14 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.99 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  30.24 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  26.83 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.75 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  28.38 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  28.23 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.98 
 
 		 463 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  28.24 
 
 		 461 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.33 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  28.39 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  29.23 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  29.39 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  30.11 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.48 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  26.72 
 
 		 461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  29.53 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  27.43 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  27.63 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  27.72 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.48 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  31.26 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  27.03 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  29.28 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.81 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  27.6 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  27.52 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  27.52 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  29.13 
 
 		 462 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  26.67 
 
 		 452 aa  127  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  27.73 
 
 		 438 aa  127  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  28.48 
 
 		 451 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  27.52 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  27.52 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  27.52 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  27.52 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.71 
 
 		 446 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  27.52 
 
 		 450 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.48 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.48 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.29 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.57 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  28.27 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.23 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.35 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  28 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  27.29 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.99 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  29.09 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  27.29 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  29.09 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  29.09 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.05 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.37 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.49 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  29.62 
 
 		 452 aa  123  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.62 
 
 		 452 aa  123  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.1 
 
 		 461 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  29.65 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  25.6 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  26.72 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.85 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>