More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2341 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  100 
 
 		 450 aa  892    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  34.35 
 
 		 454 aa  229  6e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  31.14 
 
 		 439 aa  186  8e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.12 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.08 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  33.12 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0118  RIP metalloprotease RseP  32.16 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  28.76 
 
 		 446 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  32.74 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2621  membrane-associated zinc metalloprotease  30.53 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0313354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.79 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  31.02 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  32.3 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  30.64 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.98 
 
 		 450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  27.33 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  27.94 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  28.54 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.96 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.7 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.63 
 
 		 457 aa  159  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  27.64 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  30.06 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  26.48 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  29.49 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  28.39 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  29.53 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.37 
 
 		 450 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.7 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.21 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.31 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.34 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  30.84 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  29.98 
 
 		 444 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  28.98 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  29.83 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  26.97 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  30 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  28.72 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.71 
 
 		 456 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.48 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  30.33 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.15 
 
 		 453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.86 
 
 		 495 aa  146  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  28.5 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.46 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  31.24 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1558  peptidase M50  29.2 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  30.72 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  27.89 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  26.41 
 
 		 496 aa  144  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  28.57 
 
 		 469 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.48 
 
 		 450 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  28.31 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.62 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.97 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.53 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  29.22 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.49 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.29 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  31.79 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.96 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  30.99 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  30.37 
 
 		 452 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  26.99 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  28.18 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.2 
 
 		 449 aa  139  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.7 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  27.31 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  30.18 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  30.18 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  29.95 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 		 479 aa  137  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1940  membrane-associated zinc metalloprotease  28.04 
 
 		 507 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000740913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  29.95 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  29.95 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 		 444 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  29.95 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  29.95 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.11 
 
 		 450 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  29.95 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  25.77 
 
 		 461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  27.31 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  30.04 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  26.39 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0998  peptidase RseP  29.01 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000230134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.62 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  29.73 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.39 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  30.74 
 
 		 452 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  26.62 
 
 		 450 aa  133  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  26.5 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  32.52 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  25.66 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.02 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  27.84 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.79 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  26.36 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>