More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0079 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 453 aa  910    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  69.38 
 
 		 454 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  68.6 
 
 		 453 aa  656    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  71.96 
 
 		 446 aa  670    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  71.74 
 
 		 453 aa  687    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  64.02 
 
 		 453 aa  614  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  66.23 
 
 		 453 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  39.07 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  35.4 
 
 		 444 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  36.84 
 
 		 438 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  33.7 
 
 		 438 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  36.75 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  35.57 
 
 		 438 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  34.15 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  31.51 
 
 		 439 aa  226  9e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.97 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  33.11 
 
 		 444 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  32.83 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  32.3 
 
 		 440 aa  204  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.82 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.81 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.78 
 
 		 456 aa  193  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  31.85 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.42 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  31.57 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  32.58 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.64 
 
 		 456 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.22 
 
 		 455 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.1 
 
 		 456 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29.91 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.57 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  31.71 
 
 		 456 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.47 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  32.62 
 
 		 452 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.03 
 
 		 456 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  31.59 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.59 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  31.16 
 
 		 456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  31.16 
 
 		 456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.75 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.83 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.07 
 
 		 456 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  31.73 
 
 		 452 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  31.04 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.06 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.93 
 
 		 446 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  30.46 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  28.88 
 
 		 446 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  28.46 
 
 		 463 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.69 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.72 
 
 		 441 aa  172  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  28.79 
 
 		 454 aa  172  9e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  30.7 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  29.24 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  30.53 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.72 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  30.85 
 
 		 450 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  27.94 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.96 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.47 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.44 
 
 		 455 aa  170  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  28.42 
 
 		 451 aa  170  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  29.86 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  30.57 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  28.19 
 
 		 494 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.57 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  29.98 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  29.18 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.88 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  30.08 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  28.42 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.47 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  30 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.79 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.91 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.43 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.3 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  29.35 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  28.57 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  27.84 
 
 		 456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  31.1 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  31.1 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  31.1 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  31.1 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.6 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  31.1 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  31.1 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.86 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  29.82 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  29.82 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  29.82 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  29.82 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  29.82 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  27.31 
 
 		 461 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  30.87 
 
 		 450 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  28.42 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.94 
 
 		 455 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  26.13 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4941  membrane-associated zinc metalloprotease  29.62 
 
 		 456 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  30.87 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>