More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1844 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  913    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  74.12 
 
 
452 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  74.78 
 
 
452 aa  717    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  62.83 
 
 
452 aa  612  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  54.42 
 
 
451 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  54.2 
 
 
451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  54.87 
 
 
451 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  51.97 
 
 
456 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  52.19 
 
 
456 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  55.31 
 
 
451 aa  511  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  51.97 
 
 
456 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  51.97 
 
 
456 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  54.41 
 
 
451 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  51.54 
 
 
456 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.32 
 
 
456 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.41 
 
 
461 aa  501  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.54 
 
 
456 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  52.85 
 
 
456 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  50.11 
 
 
461 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  53.1 
 
 
450 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  53.1 
 
 
450 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  53.1 
 
 
450 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  52.88 
 
 
450 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  51.32 
 
 
456 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  53.1 
 
 
450 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.66 
 
 
453 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  53.76 
 
 
451 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  53.54 
 
 
451 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  53.76 
 
 
451 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  52.65 
 
 
450 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.75 
 
 
456 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.32 
 
 
456 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  51.32 
 
 
456 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.54 
 
 
456 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  53.1 
 
 
450 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  53.1 
 
 
450 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  52.88 
 
 
450 aa  484  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  53.1 
 
 
450 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  53.1 
 
 
450 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  53.1 
 
 
450 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  52.65 
 
 
450 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  52.88 
 
 
450 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  52.65 
 
 
450 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  49.56 
 
 
450 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  47.79 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  49.12 
 
 
450 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.85 
 
 
458 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.78 
 
 
451 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  45.76 
 
 
443 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.1 
 
 
448 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  43.79 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  43.14 
 
 
454 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  41.65 
 
 
450 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  40.85 
 
 
450 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.2 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.2 
 
 
450 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.4 
 
 
450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.98 
 
 
450 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  39.96 
 
 
450 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  40.18 
 
 
450 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  42.54 
 
 
454 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.56 
 
 
450 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.37 
 
 
449 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  39.91 
 
 
450 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40 
 
 
455 aa  348  8e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.72 
 
 
455 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.63 
 
 
454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  38.71 
 
 
454 aa  330  4e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.18 
 
 
455 aa  326  6e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  39.68 
 
 
450 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  39.96 
 
 
454 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  41.72 
 
 
453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.98 
 
 
450 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  39.87 
 
 
466 aa  316  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.87 
 
 
455 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.37 
 
 
454 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  39.68 
 
 
475 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.24 
 
 
417 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  37 
 
 
457 aa  291  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.36 
 
 
457 aa  289  6e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  34.93 
 
 
448 aa  282  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  34.12 
 
 
469 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  35.48 
 
 
462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  37.2 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.48 
 
 
462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.1 
 
 
479 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  36.99 
 
 
461 aa  272  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.68 
 
 
456 aa  272  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  37.26 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  34.69 
 
 
463 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  35 
 
 
456 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.27 
 
 
463 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.05 
 
 
463 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  36.92 
 
 
452 aa  262  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.92 
 
 
452 aa  262  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  35.6 
 
 
453 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.79 
 
 
457 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.79 
 
 
457 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.27 
 
 
463 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  35.57 
 
 
457 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>