More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3176 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
444 aa  889    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  46.62 
 
 
438 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  47.19 
 
 
438 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  43.47 
 
 
444 aa  365  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  45.89 
 
 
430 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  43.15 
 
 
438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  43.4 
 
 
442 aa  336  5e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  42.4 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.24 
 
 
439 aa  305  9.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  40.95 
 
 
440 aa  305  9.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  38.41 
 
 
453 aa  272  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.52 
 
 
453 aa  270  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  37 
 
 
453 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  36.96 
 
 
446 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  35.4 
 
 
453 aa  266  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  37 
 
 
453 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.73 
 
 
454 aa  260  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  34.84 
 
 
469 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.9 
 
 
449 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  33.05 
 
 
439 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  29.7 
 
 
463 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  29.89 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  31.19 
 
 
428 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  28.36 
 
 
494 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  30.18 
 
 
454 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.06 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.85 
 
 
450 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.06 
 
 
450 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.11 
 
 
455 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  28.42 
 
 
450 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  30.31 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.91 
 
 
454 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.45 
 
 
441 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.95 
 
 
446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.3 
 
 
452 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  30.3 
 
 
452 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  28.97 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  27.62 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.94 
 
 
455 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  29.41 
 
 
451 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  30.13 
 
 
443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.07 
 
 
450 aa  163  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  28.19 
 
 
454 aa  162  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  29.19 
 
 
451 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  30.26 
 
 
450 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  30.26 
 
 
450 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  30.26 
 
 
450 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  30.26 
 
 
450 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  28.48 
 
 
454 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  30.38 
 
 
446 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.16 
 
 
456 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  30.18 
 
 
450 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  28.88 
 
 
452 aa  156  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.69 
 
 
450 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  28.33 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  29.82 
 
 
452 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.03 
 
 
451 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.39 
 
 
480 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  27.54 
 
 
450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  27.83 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.78 
 
 
457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29.53 
 
 
438 aa  152  8.999999999999999e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  27.96 
 
 
450 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  29.96 
 
 
450 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.6 
 
 
448 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.33 
 
 
453 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  27.14 
 
 
450 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  30.18 
 
 
450 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  30.18 
 
 
450 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  30.18 
 
 
450 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  27.89 
 
 
451 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  29.41 
 
 
452 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  30.18 
 
 
450 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  29.96 
 
 
450 aa  150  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  27.53 
 
 
461 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  28.41 
 
 
452 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.35 
 
 
450 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.88 
 
 
456 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.32 
 
 
455 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  27.75 
 
 
488 aa  149  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.29 
 
 
479 aa  149  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  29.14 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  26.89 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  29.96 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  28.95 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  28.26 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.48 
 
 
450 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.62 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  28.26 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.76 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  28.26 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  29.96 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.14 
 
 
452 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  28.81 
 
 
469 aa  146  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.51 
 
 
444 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.19 
 
 
456 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  27.45 
 
 
457 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  26.36 
 
 
456 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  27 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>