More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0892 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
439 aa  876    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  47.17 
 
 
438 aa  388  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.43 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  35.79 
 
 
446 aa  274  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.71 
 
 
455 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.24 
 
 
449 aa  256  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.8 
 
 
455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.5 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.85 
 
 
456 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.09 
 
 
456 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  35.98 
 
 
443 aa  251  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  35.7 
 
 
461 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.89 
 
 
450 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.76 
 
 
448 aa  251  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.45 
 
 
450 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  38.51 
 
 
450 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  38.51 
 
 
450 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  38.51 
 
 
450 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  38.51 
 
 
450 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.11 
 
 
450 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.2 
 
 
451 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.74 
 
 
456 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.79 
 
 
456 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  34.35 
 
 
450 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.44 
 
 
456 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  34.57 
 
 
452 aa  246  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  36.23 
 
 
456 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.13 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  38.29 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.14 
 
 
456 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.11 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  38.99 
 
 
450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.14 
 
 
456 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  38.82 
 
 
450 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  38.82 
 
 
450 aa  243  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  38.82 
 
 
450 aa  243  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  38.82 
 
 
450 aa  243  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  38.82 
 
 
450 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  34.71 
 
 
450 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  36.56 
 
 
469 aa  242  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  34.42 
 
 
452 aa  242  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  35.71 
 
 
452 aa  242  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  36.02 
 
 
450 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  35.14 
 
 
456 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35 
 
 
456 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  38.77 
 
 
450 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  35.14 
 
 
456 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.7 
 
 
450 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  35.14 
 
 
456 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  33.88 
 
 
469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  36.74 
 
 
451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  38.6 
 
 
450 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  38.6 
 
 
450 aa  240  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  34.72 
 
 
466 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  32.47 
 
 
456 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  35.43 
 
 
452 aa  236  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  33.41 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  32.9 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  35.79 
 
 
475 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  33.04 
 
 
450 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  31.69 
 
 
463 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  35.81 
 
 
451 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  32.75 
 
 
450 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.97 
 
 
454 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  32.68 
 
 
454 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.83 
 
 
450 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  36.76 
 
 
450 aa  229  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.97 
 
 
452 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  32.82 
 
 
453 aa  227  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  30.87 
 
 
454 aa  227  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.48 
 
 
455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  36.46 
 
 
451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  34.13 
 
 
452 aa  226  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  35.59 
 
 
451 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  31.51 
 
 
453 aa  226  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.14 
 
 
450 aa  226  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  35.95 
 
 
451 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  34.19 
 
 
457 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  32.48 
 
 
456 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  33.91 
 
 
452 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.91 
 
 
452 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.76 
 
 
457 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  29.93 
 
 
453 aa  223  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  31.45 
 
 
454 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  35.81 
 
 
451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  35.81 
 
 
451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.52 
 
 
455 aa  223  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  33.55 
 
 
459 aa  223  6e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  35.81 
 
 
451 aa  222  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.93 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.76 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  31.09 
 
 
453 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.68 
 
 
453 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  33.19 
 
 
453 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  31.4 
 
 
446 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  31.69 
 
 
462 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.75 
 
 
454 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  33.71 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.69 
 
 
462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.44 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>