More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1349 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  87.01 
 
 		 462 aa  784    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 462 aa  920    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  96.54 
 
 		 462 aa  871    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  58.84 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  60.13 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  45.83 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  45.24 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.24 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  45.39 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.73 
 
 		 457 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.73 
 
 		 457 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  45.51 
 
 		 457 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  45.87 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  47.08 
 
 		 462 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  45.43 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.79 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45.79 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.79 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.79 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.61 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  42.68 
 
 		 456 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  44.44 
 
 		 454 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.06 
 
 		 455 aa  335  9e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  43.52 
 
 		 454 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  41.29 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.42 
 
 		 454 aa  312  9e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.91 
 
 		 455 aa  310  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1830  peptidase RseP  44.97 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.91 
 
 		 455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  40.99 
 
 		 453 aa  306  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  43.36 
 
 		 453 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4941  membrane-associated zinc metalloprotease  41.38 
 
 		 456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  38.36 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.21 
 
 		 454 aa  297  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1765  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.89 
 
 		 458 aa  296  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2688  peptidase RseP  42.8 
 
 		 458 aa  296  7e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.214721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1995  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.78 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.92 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.36 
 
 		 450 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.75 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.34 
 
 		 456 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  37.12 
 
 		 456 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.57 
 
 		 450 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1445  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.04 
 
 		 459 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.12 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.45 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  38.84 
 
 		 450 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  35.73 
 
 		 452 aa  279  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.34 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.35 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1230  membrane-associated zinc metalloprotease  43.63 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  40.04 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2578  peptidase RseP  43.63 
 
 		 454 aa  277  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.041357  normal  0.0436564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.48 
 
 		 456 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.99 
 
 		 456 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  40.99 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.95 
 
 		 448 aa  276  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.54 
 
 		 453 aa  276  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  37.12 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  40.21 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  38.28 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.28 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  40.69 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  38.74 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  39.87 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  40.69 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  40.69 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  40.69 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  37.08 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.02 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.42 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  37.08 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.66 
 
 		 452 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.66 
 
 		 450 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.4 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  38.25 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  40.26 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  40.26 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  40.26 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  40.26 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  40.26 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  40.26 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  40.04 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  40.48 
 
 		 450 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.04 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  39.87 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  40.04 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  40.04 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  39.87 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.65 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.45 
 
 		 456 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  39.66 
 
 		 451 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  38.79 
 
 		 466 aa  266  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  39.7 
 
 		 450 aa  265  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  37.01 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  39.3 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>