More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1445 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1445  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
459 aa  901    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1830  peptidase RseP  71.99 
 
 
455 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2578  peptidase RseP  71.33 
 
 
454 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.041357  normal  0.0436564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1230  membrane-associated zinc metalloprotease  71.33 
 
 
454 aa  579  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  63.91 
 
 
456 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2688  peptidase RseP  62.47 
 
 
458 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.214721  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1995  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  65.35 
 
 
453 aa  542  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1765  putative membrane-associated zinc metalloprotease  60.65 
 
 
458 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4941  membrane-associated zinc metalloprotease  61.49 
 
 
456 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  53.48 
 
 
453 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  47.36 
 
 
491 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  44.35 
 
 
456 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.28 
 
 
463 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  44.18 
 
 
462 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  47.1 
 
 
454 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.18 
 
 
462 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  44.8 
 
 
463 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  44.8 
 
 
463 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  44.8 
 
 
463 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.8 
 
 
463 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.8 
 
 
463 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  44.8 
 
 
463 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.8 
 
 
463 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  45.12 
 
 
456 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.25 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.25 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  44.03 
 
 
457 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  43.75 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  44.04 
 
 
462 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.33 
 
 
455 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  43.53 
 
 
461 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  43.59 
 
 
463 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.68 
 
 
455 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.98 
 
 
455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  43.36 
 
 
463 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  40.04 
 
 
462 aa  298  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  41.88 
 
 
454 aa  296  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.45 
 
 
454 aa  293  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  40.04 
 
 
462 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  39.61 
 
 
462 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  41.88 
 
 
453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  41.13 
 
 
454 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  41.45 
 
 
450 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  41.2 
 
 
450 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.07 
 
 
455 aa  277  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.94 
 
 
454 aa  277  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.77 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.09 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  41.24 
 
 
450 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  36.04 
 
 
469 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  40.6 
 
 
450 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  38.44 
 
 
451 aa  266  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.45 
 
 
450 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  40.94 
 
 
450 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.68 
 
 
456 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  37.01 
 
 
456 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.64 
 
 
450 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.74 
 
 
456 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.01 
 
 
456 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  36.38 
 
 
456 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.66 
 
 
456 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  36.52 
 
 
456 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  36.52 
 
 
456 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.45 
 
 
456 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.7 
 
 
456 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.45 
 
 
448 aa  257  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.74 
 
 
452 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  38.74 
 
 
452 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  37.68 
 
 
451 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  38.88 
 
 
451 aa  255  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.6 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  38.1 
 
 
450 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  38.28 
 
 
450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.21 
 
 
450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.17 
 
 
450 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  37.83 
 
 
451 aa  253  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  38.06 
 
 
450 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  38.06 
 
 
450 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  38.06 
 
 
450 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  38.06 
 
 
450 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  37.66 
 
 
450 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  38.06 
 
 
450 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.91 
 
 
453 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  37.66 
 
 
450 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  37.66 
 
 
450 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  37.66 
 
 
450 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  39.06 
 
 
451 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.97 
 
 
450 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  38.06 
 
 
450 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.34 
 
 
456 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  37.85 
 
 
450 aa  250  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  35.78 
 
 
461 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  37.45 
 
 
450 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.99 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  37.63 
 
 
450 aa  246  6.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  34.84 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.03 
 
 
450 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.41 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  36.74 
 
 
451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  36.74 
 
 
451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>