More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1765 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1765  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 458 aa  917    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2688  peptidase RseP  84.72 
 
 		 458 aa  748    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.214721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  67.32 
 
 		 456 aa  626  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1830  peptidase RseP  67.32 
 
 		 455 aa  579  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1230  membrane-associated zinc metalloprotease  68.78 
 
 		 454 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2578  peptidase RseP  68.78 
 
 		 454 aa  571  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.041357  normal  0.0436564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1995  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  65.72 
 
 		 453 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1445  putative membrane-associated zinc metalloprotease  60.65 
 
 		 459 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4941  membrane-associated zinc metalloprotease  57.79 
 
 		 456 aa  504  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  56.53 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  48.27 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  44.81 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.15 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  46.15 
 
 		 462 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  45.91 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  45.36 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.14 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.14 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  46.17 
 
 		 462 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.15 
 
 		 463 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  46.15 
 
 		 461 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.37 
 
 		 463 aa  352  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  45.3 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.15 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.15 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.94 
 
 		 463 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45.94 
 
 		 463 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.94 
 
 		 463 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.94 
 
 		 463 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  43.95 
 
 		 463 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.95 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  44.61 
 
 		 454 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.72 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.58 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  40.89 
 
 		 462 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  39.79 
 
 		 462 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  40.47 
 
 		 462 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  44.82 
 
 		 463 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  41.63 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.83 
 
 		 454 aa  303  6.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.82 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  36.38 
 
 		 469 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  40.48 
 
 		 450 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.62 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  38.71 
 
 		 451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.36 
 
 		 456 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  39.28 
 
 		 454 aa  282  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  38.94 
 
 		 454 aa  282  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  39.91 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.12 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  39.61 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  38.68 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  39.36 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  39.36 
 
 		 456 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.4 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  38.41 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.56 
 
 		 452 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  38.97 
 
 		 456 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.56 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  39.19 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.76 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.63 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.63 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  37.31 
 
 		 451 aa  272  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.44 
 
 		 451 aa  272  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  40.21 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.79 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  38.64 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  38.43 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  38.43 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  37.58 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  38.43 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  38.43 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  38.43 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  38.22 
 
 		 450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.65 
 
 		 450 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  39.19 
 
 		 450 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.52 
 
 		 448 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  37.82 
 
 		 451 aa  266  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  37.82 
 
 		 451 aa  266  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  38.58 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  37.47 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  37.68 
 
 		 450 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  37.23 
 
 		 451 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  37.68 
 
 		 450 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  37.68 
 
 		 450 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  37.68 
 
 		 450 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  38.9 
 
 		 466 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  38 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  36.27 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.58 
 
 		 457 aa  263  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  35.74 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.83 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  35.27 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.86 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  36.81 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  37.26 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  37.47 
 
 		 450 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.45 
 
 		 450 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.31 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>