More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2148 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 444 aa  890    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  86.71 
 
 		 444 aa  773    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  86.49 
 
 		 444 aa  774    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  61.49 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  58.64 
 
 		 443 aa  501  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  56.44 
 
 		 450 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  52.74 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.34 
 
 		 480 aa  252  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  34.82 
 
 		 494 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  32.96 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  33.87 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.41 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  31.68 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  31.97 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.76 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  30.69 
 
 		 452 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  31.45 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  32.97 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  33.12 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.3 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.19 
 
 		 462 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  31.59 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.29 
 
 		 450 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  31.3 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.43 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  32.95 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  31.96 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  32.98 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  33.8 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  32.47 
 
 		 456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  31.72 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  31.72 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  31.72 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.72 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  35.29 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  28.66 
 
 		 456 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.49 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.32 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.31 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.24 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  35.32 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.3 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  29.53 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.05 
 
 		 463 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.6 
 
 		 456 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  29.53 
 
 		 456 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.36 
 
 		 458 aa  193  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.89 
 
 		 450 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  31.82 
 
 		 457 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.82 
 
 		 457 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.82 
 
 		 457 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  31.17 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  32.03 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  30.79 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.41 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.39 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  31.97 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  29.31 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.33 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.32 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  29.64 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  30.09 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.41 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.41 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.83 
 
 		 456 aa  190  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.86 
 
 		 379 aa  190  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.2 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.2 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.2 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.2 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  33.05 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.83 
 
 		 449 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.72 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.55 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.41 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  29.95 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.46 
 
 		 456 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  29.95 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  29.72 
 
 		 451 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  30.04 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  29.82 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  29.82 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.88 
 
 		 456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  29.82 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  29.82 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  29.82 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  29.82 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  28.79 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.96 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  29.82 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.96 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  29.49 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  31.9 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  28.12 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  27.53 
 
 		 459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.63 
 
 		 456 aa  182  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  29.6 
 
 		 450 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  31.51 
 
 		 463 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  31.48 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>