More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11310 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  100 
 
 
442 aa  872    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  54.81 
 
 
443 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  53.47 
 
 
443 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  51.35 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  51.46 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  52.6 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  51.43 
 
 
455 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  48.75 
 
 
442 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  47.96 
 
 
438 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  45 
 
 
431 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  46.47 
 
 
434 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  42.95 
 
 
453 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  46.15 
 
 
439 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  48.72 
 
 
432 aa  350  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  44.32 
 
 
450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  38.38 
 
 
451 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  40.85 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  41.45 
 
 
454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  49.18 
 
 
438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  38.04 
 
 
393 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  38.74 
 
 
394 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  31.28 
 
 
428 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  35.31 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  34.58 
 
 
412 aa  223  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  36.14 
 
 
402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  34.45 
 
 
404 aa  210  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  33.48 
 
 
403 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  33.26 
 
 
413 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  31.99 
 
 
404 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  31.99 
 
 
404 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  31.99 
 
 
404 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  35.15 
 
 
416 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  34.72 
 
 
416 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  32.75 
 
 
408 aa  193  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  35.84 
 
 
397 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  31.14 
 
 
412 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  30.89 
 
 
413 aa  156  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.69 
 
 
339 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  29.5 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.64 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.78 
 
 
367 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.31 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  26.52 
 
 
347 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  28.21 
 
 
354 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  27.62 
 
 
338 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.4 
 
 
345 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  28.88 
 
 
379 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.08 
 
 
357 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  30.49 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  29.04 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  27.42 
 
 
353 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  27.96 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.46 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  28.82 
 
 
428 aa  118  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.58 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.66 
 
 
561 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  33.47 
 
 
561 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  33.47 
 
 
561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  29.36 
 
 
383 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.3 
 
 
354 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  25.58 
 
 
348 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  27.55 
 
 
383 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  28.02 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  29.04 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  28.38 
 
 
354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  29.04 
 
 
351 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.15 
 
 
343 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.73 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.13 
 
 
385 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  30.67 
 
 
379 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.67 
 
 
379 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  32.13 
 
 
549 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.77 
 
 
383 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.4 
 
 
558 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  26.46 
 
 
376 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 
386 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  25.2 
 
 
355 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  24.2 
 
 
341 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  27.51 
 
 
369 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  25.98 
 
 
355 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  25.71 
 
 
352 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  24.69 
 
 
380 aa  104  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  25 
 
 
376 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  30.72 
 
 
469 aa  104  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  27.61 
 
 
386 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.85 
 
 
383 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  28.47 
 
 
438 aa  103  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  27.83 
 
 
439 aa  103  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.1 
 
 
428 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.1 
 
 
428 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.18 
 
 
380 aa  103  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  26.42 
 
 
419 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  29.6 
 
 
438 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.2 
 
 
350 aa  103  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.04 
 
 
355 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  26.41 
 
 
364 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  27.61 
 
 
386 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  26.14 
 
 
417 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  26.22 
 
 
336 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.89 
 
 
379 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>