More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2356 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 386 aa  764    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  99.74 
 
 		 386 aa  761    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  97.67 
 
 		 386 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  77.89 
 
 		 384 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  69.77 
 
 		 386 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  68.99 
 
 		 386 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  60 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  58.68 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  56.58 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.89 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  58.42 
 
 		 383 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.11 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  58.11 
 
 		 383 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  58.68 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  58.27 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  55.15 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  51.06 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  51.52 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  51.09 
 
 		 373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  52.85 
 
 		 381 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  52.21 
 
 		 379 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  50.14 
 
 		 374 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.43 
 
 		 377 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  49.59 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  49.72 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  49.32 
 
 		 379 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.44 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  44.44 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  48.19 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.53 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.41 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  40.6 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.37 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  41.3 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  34.59 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.09 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  38.29 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.19 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  37.6 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  37.88 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.02 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.64 
 
 		 355 aa  215  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.46 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  37.54 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  34.14 
 
 		 376 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  34.33 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.45 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  36.16 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  35.42 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.04 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.89 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  34.47 
 
 		 377 aa  186  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  33.15 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.25 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.05 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  37.36 
 
 		 360 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.89 
 
 		 368 aa  179  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.77 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  32.84 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.73 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.17 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  34.1 
 
 		 396 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.01 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  40.32 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  32.96 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  34.37 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.93 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  35 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  33.16 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.91 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.91 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  29.15 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  29.15 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.84 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.15 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.91 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  29.15 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  28.91 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.91 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  29.15 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  40.34 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  31.84 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  33.53 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  30.81 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  39.5 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  40.95 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  31.71 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  30.7 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1290  hypothetical protein  29.94 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  38.94 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  30.75 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  32.6 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  30.43 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  33.04 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.54 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  44.74 
 
 		 443 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.71 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0572  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.93 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.763632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.94 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>