More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1444 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 377 aa  750    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  74.01 
 
 		 377 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  35.7 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.94 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.69 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.96 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.44 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.98 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  33.16 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  32.16 
 
 		 454 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.17 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.12 
 
 		 366 aa  179  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.24 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  31.42 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.38 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  31.1 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  32.36 
 
 		 386 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  33.16 
 
 		 367 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 		 386 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  31.79 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.68 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  31.62 
 
 		 453 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  31.66 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  32.53 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  33.51 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  30.51 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  31.56 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  30.52 
 
 		 355 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.16 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  41.1 
 
 		 463 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  32 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  33.16 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  33.88 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  30.4 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.03 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.27 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  31.91 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  29.79 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  33.24 
 
 		 379 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  31.82 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.65 
 
 		 380 aa  155  8e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  31.38 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.7 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.18 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.76 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.67 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  38.79 
 
 		 456 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  28.72 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.21 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  30 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.35 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  32.45 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.73 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  27.37 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  31.12 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  41 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.5 
 
 		 448 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2281  hypothetical protein  29.63 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.3 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  39.91 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  39.48 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  39.66 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.48 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.59 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  45.5 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  39.74 
 
 		 491 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  31.46 
 
 		 381 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2253  hypothetical protein  28.35 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.42 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  26.65 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  41.49 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  43.62 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  44.97 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.18 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.73 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  43.09 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.06 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  34.66 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  31.42 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.32 
 
 		 450 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  38.16 
 
 		 450 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  38.16 
 
 		 450 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.74 
 
 		 452 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  42.44 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  37.77 
 
 		 451 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.32 
 
 		 450 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.18 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  38.63 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  43.4 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  37.72 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  37.72 
 
 		 450 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  37.72 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  37.72 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  37.72 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>