More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0623 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 
368 aa  728    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  62.54 
 
 
368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  62.39 
 
 
368 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  64.47 
 
 
368 aa  444  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  56.59 
 
 
370 aa  424  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  58.36 
 
 
370 aa  424  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  56.87 
 
 
369 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  54.79 
 
 
370 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  50.72 
 
 
352 aa  347  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  46.88 
 
 
350 aa  312  6.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  38.54 
 
 
376 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  39.26 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  37.39 
 
 
355 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.23 
 
 
355 aa  222  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  34.66 
 
 
354 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.83 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  34.28 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.07 
 
 
367 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.21 
 
 
355 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  36.02 
 
 
356 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.4 
 
 
377 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  32.34 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  34.12 
 
 
354 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.38 
 
 
354 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.64 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  33.98 
 
 
369 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  29.89 
 
 
373 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  29.51 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.16 
 
 
343 aa  189  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.39 
 
 
385 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.85 
 
 
361 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  37.22 
 
 
347 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.34 
 
 
392 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  33.24 
 
 
367 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  31.4 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.8 
 
 
357 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.82 
 
 
335 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 
338 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.33 
 
 
380 aa  178  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.52 
 
 
335 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.2 
 
 
339 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.08 
 
 
372 aa  177  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  33.05 
 
 
383 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.11 
 
 
383 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.96 
 
 
383 aa  176  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  32.02 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  34.07 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  32.58 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.55 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.96 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  31.67 
 
 
386 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.89 
 
 
374 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  34.28 
 
 
360 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.39 
 
 
383 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  30.17 
 
 
367 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.18 
 
 
332 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  31.68 
 
 
383 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  29.72 
 
 
386 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  33.04 
 
 
384 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  31.18 
 
 
386 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  31.25 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  31.56 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.49 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  30.7 
 
 
354 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.55 
 
 
345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  31.18 
 
 
377 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.01 
 
 
353 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  33.71 
 
 
341 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  29.78 
 
 
386 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  29.78 
 
 
386 aa  159  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.18 
 
 
377 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  31.01 
 
 
336 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 
348 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  32.4 
 
 
353 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  30.21 
 
 
337 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  30.64 
 
 
337 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  37.28 
 
 
439 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  29.2 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.46 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  33.15 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  30.62 
 
 
342 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  33.87 
 
 
454 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.55 
 
 
379 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.53 
 
 
383 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.59 
 
 
428 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.59 
 
 
428 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  30.26 
 
 
379 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.39 
 
 
379 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  31.71 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  31.42 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.02 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  31.67 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.45 
 
 
418 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  32.45 
 
 
418 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.59 
 
 
424 aa  139  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.59 
 
 
418 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1290  hypothetical protein  31.78 
 
 
359 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  31.7 
 
 
420 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.7 
 
 
418 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.7 
 
 
418 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>