More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1953 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 		 361 aa  717    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  56.06 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  52.08 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  43.7 
 
 		 386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  43.17 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.89 
 
 		 383 aa  295  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.38 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  45.3 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  42.58 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  44.44 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  42.33 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  44.16 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.47 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  41.13 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.72 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.33 
 
 		 383 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  43.6 
 
 		 379 aa  282  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  43.97 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  45.56 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  39.72 
 
 		 375 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.57 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.76 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  44.23 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  43.18 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  40.62 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.34 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.57 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.62 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.63 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  37.54 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.7 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  40.7 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.69 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.13 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  39.49 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.22 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  36.47 
 
 		 369 aa  216  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  38.64 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.88 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.4 
 
 		 353 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  36.64 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  33.82 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  36.49 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  34.96 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  35.69 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.06 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  33.88 
 
 		 450 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.8 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.72 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  34.55 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  32.95 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  34.19 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.96 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  33.91 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.87 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  33.14 
 
 		 354 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.16 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.96 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  34.48 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  33.04 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.54 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.73 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  30.11 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  33.05 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.85 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.86 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  34.19 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.35 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.92 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  34.88 
 
 		 396 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.87 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.95 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.4 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.41 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.38 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  34.38 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  30.85 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.43 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  30.43 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  30.43 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.79 
 
 		 424 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.01 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.77 
 
 		 456 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.3 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  35.71 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  37.84 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.84 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.84 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.91 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.21 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  37.93 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  38.29 
 
 		 462 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  32.25 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  32.27 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  38.18 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.29 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.6 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.93 
 
 		 456 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>