More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2042 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
386 aa  764    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  97.67 
 
 
386 aa  729    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  97.41 
 
 
386 aa  726    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  78.95 
 
 
384 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  70.8 
 
 
386 aa  544  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  69.51 
 
 
386 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  60.52 
 
 
385 aa  441  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.11 
 
 
383 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  58.68 
 
 
383 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.37 
 
 
383 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.89 
 
 
383 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  57.57 
 
 
383 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.33 
 
 
383 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  59.47 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  55.67 
 
 
392 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  58.27 
 
 
381 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  50.8 
 
 
377 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  51.52 
 
 
375 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  51.36 
 
 
373 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  53.04 
 
 
379 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  52.3 
 
 
381 aa  339  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  50.29 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.43 
 
 
377 aa  308  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  49.59 
 
 
379 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  49.45 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  49.32 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  45.3 
 
 
361 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  44.44 
 
 
373 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  49.3 
 
 
367 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.8 
 
 
372 aa  261  1e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.74 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  40.87 
 
 
367 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  41.53 
 
 
369 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  34.59 
 
 
380 aa  232  8.000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.77 
 
 
380 aa  231  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.66 
 
 
366 aa  229  7e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.69 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  37.68 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.85 
 
 
355 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  37.96 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  37.19 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.57 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
353 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  37.78 
 
 
354 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  35.15 
 
 
347 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  33.6 
 
 
376 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  36.44 
 
 
356 aa  190  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.92 
 
 
354 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  36.14 
 
 
355 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  35 
 
 
377 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.77 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.61 
 
 
368 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  38.19 
 
 
360 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.58 
 
 
372 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.61 
 
 
368 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  32.59 
 
 
338 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  32.54 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.43 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  33.24 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.73 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  41.13 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.49 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.68 
 
 
480 aa  173  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29.6 
 
 
438 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  34.93 
 
 
352 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  35.87 
 
 
369 aa  169  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  34.1 
 
 
396 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  32.34 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.93 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.44 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  41.2 
 
 
450 aa  166  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.2 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.44 
 
 
420 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  28.67 
 
 
420 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  28.67 
 
 
420 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.67 
 
 
418 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.44 
 
 
418 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  28.67 
 
 
420 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.44 
 
 
418 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  28.44 
 
 
418 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  28.67 
 
 
420 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.44 
 
 
418 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  32.35 
 
 
388 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  33.23 
 
 
364 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  41.38 
 
 
453 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  39.92 
 
 
454 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  31.28 
 
 
370 aa  158  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.46 
 
 
368 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  39.38 
 
 
456 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  32.35 
 
 
337 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.4 
 
 
444 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.38 
 
 
457 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.38 
 
 
457 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  39.38 
 
 
462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  30.18 
 
 
359 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  39.38 
 
 
457 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.38 
 
 
462 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  32.05 
 
 
348 aa  152  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.6 
 
 
445 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>