More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3189 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
392 aa  789    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  65.48 
 
 
383 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  63.03 
 
 
383 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  60.9 
 
 
383 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  61.17 
 
 
383 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  62.19 
 
 
383 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  64.36 
 
 
383 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  60.31 
 
 
385 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  57.88 
 
 
383 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  56.87 
 
 
386 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  55.67 
 
 
386 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  55.49 
 
 
386 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  55.15 
 
 
386 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  55.15 
 
 
386 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  51.66 
 
 
375 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  48.55 
 
 
377 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  48.22 
 
 
373 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  54.08 
 
 
381 aa  363  4e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  55.94 
 
 
384 aa  362  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  50.87 
 
 
374 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  48.93 
 
 
379 aa  346  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  49.86 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  47.57 
 
 
381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  45.36 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.67 
 
 
377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  48.63 
 
 
379 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  48.34 
 
 
379 aa  292  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  48.32 
 
 
379 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.72 
 
 
361 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.05 
 
 
372 aa  271  2e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.07 
 
 
366 aa  268  1e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  40.53 
 
 
367 aa  259  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.29 
 
 
380 aa  255  8e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  37.91 
 
 
380 aa  255  9e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.67 
 
 
355 aa  250  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.15 
 
 
367 aa  242  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  38.01 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.76 
 
 
353 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  37.16 
 
 
356 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  35.01 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  32.3 
 
 
443 aa  212  9e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  46.64 
 
 
494 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  34.73 
 
 
354 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  36.68 
 
 
354 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.34 
 
 
347 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  35.07 
 
 
355 aa  205  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.92 
 
 
355 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  35.91 
 
 
355 aa  203  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.05 
 
 
354 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  33.87 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  33.96 
 
 
377 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  34.63 
 
 
347 aa  193  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.81 
 
 
357 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.01 
 
 
339 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.69 
 
 
377 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.22 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.26 
 
 
355 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  31.51 
 
 
338 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.22 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.23 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.94 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.34 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.39 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  37.47 
 
 
341 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.95 
 
 
451 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.85 
 
 
350 aa  180  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.73 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  36.31 
 
 
360 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.28 
 
 
441 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  31.23 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  31.32 
 
 
352 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  33.24 
 
 
369 aa  170  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  32.43 
 
 
354 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  27.12 
 
 
370 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  33.25 
 
 
396 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.9 
 
 
418 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  29.01 
 
 
420 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  29.01 
 
 
420 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.01 
 
 
418 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  29.01 
 
 
420 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  29.01 
 
 
420 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  29.89 
 
 
422 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.42 
 
 
418 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  30.82 
 
 
417 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  30.73 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.12 
 
 
332 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  28.4 
 
 
361 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  30.81 
 
 
348 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.88 
 
 
454 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  38.24 
 
 
453 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  27.81 
 
 
361 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0572  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.56 
 
 
360 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.763632  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  31.09 
 
 
353 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.4 
 
 
455 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  32.54 
 
 
419 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.13 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2253  hypothetical protein  29.17 
 
 
355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.13 
 
 
418 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.9 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  28.13 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>