More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0296 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 381 aa  767    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  73.49 
 
 		 381 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  54.7 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  53.87 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  53.59 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  53.17 
 
 		 386 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  52.62 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  52.33 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  53.59 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  53.04 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  52.85 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  52.85 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  54.76 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  52.3 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  50 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  53.04 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  45.21 
 
 		 373 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  47.57 
 
 		 392 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  45.43 
 
 		 377 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  44.97 
 
 		 375 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.22 
 
 		 374 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  44.3 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  45.38 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.01 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  43.18 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.49 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  42.9 
 
 		 379 aa  271  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  39.39 
 
 		 373 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.99 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.19 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.85 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.44 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.54 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  34.99 
 
 		 380 aa  236  7e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  38.2 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.47 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  37.32 
 
 		 354 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  33.93 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.72 
 
 		 353 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  36.11 
 
 		 369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  36.63 
 
 		 376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  36.24 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  37.29 
 
 		 356 aa  209  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.81 
 
 		 354 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  35.73 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  34.35 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  33.8 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  34.73 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.25 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.38 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.1 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.81 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.96 
 
 		 441 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  32.81 
 
 		 443 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.77 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.61 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  35.83 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  31.93 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  29.89 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.04 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  33.87 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  34.05 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  33.51 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.69 
 
 		 355 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.35 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  31.96 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  32.43 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  41.95 
 
 		 494 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.66 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  32.88 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.71 
 
 		 377 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  31.4 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.15 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  28.42 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.59 
 
 		 480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  32.91 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.1 
 
 		 445 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  29.65 
 
 		 457 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.08 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.86 
 
 		 456 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.65 
 
 		 347 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  33.89 
 
 		 341 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.24 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  32.3 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  28.38 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.59 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  27.59 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.36 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.36 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.86 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.36 
 
 		 418 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  27.36 
 
 		 417 aa  152  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.06 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  35.59 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.75 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>