More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1532 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  90.16 
 
 
386 aa  700    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
386 aa  765    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  70.8 
 
 
386 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  69.77 
 
 
386 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  69.77 
 
 
386 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  68.09 
 
 
384 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  58.01 
 
 
383 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  58.67 
 
 
383 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  60.44 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  57.74 
 
 
383 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.6 
 
 
383 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.07 
 
 
383 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  55.47 
 
 
383 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  56.84 
 
 
383 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  55.49 
 
 
392 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  54.33 
 
 
381 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  49.06 
 
 
377 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  50.14 
 
 
375 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  53.17 
 
 
381 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  46.43 
 
 
373 aa  332  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  48.63 
 
 
374 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  50.82 
 
 
367 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  48.12 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  47.54 
 
 
379 aa  308  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  47.54 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  47.25 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.8 
 
 
377 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.58 
 
 
361 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  44.5 
 
 
373 aa  286  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.47 
 
 
372 aa  259  7e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  39.51 
 
 
367 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.22 
 
 
355 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  35 
 
 
380 aa  239  6.999999999999999e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.17 
 
 
380 aa  234  3e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.41 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.03 
 
 
353 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  37.5 
 
 
354 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.25 
 
 
367 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  37.43 
 
 
354 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.59 
 
 
355 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.77 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  36.87 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  35.93 
 
 
355 aa  212  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  36.94 
 
 
369 aa  209  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  34.22 
 
 
376 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.64 
 
 
354 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.26 
 
 
480 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  34 
 
 
396 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  35.18 
 
 
356 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.16 
 
 
357 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  35.79 
 
 
355 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  30.04 
 
 
443 aa  186  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.84 
 
 
449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  32.43 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  36.36 
 
 
360 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.33 
 
 
368 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.15 
 
 
343 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.31 
 
 
368 aa  176  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.07 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  30.21 
 
 
439 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  34.65 
 
 
352 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41 
 
 
456 aa  170  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  32.49 
 
 
347 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  33.79 
 
 
370 aa  168  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.56 
 
 
377 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  34.07 
 
 
369 aa  166  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  30.36 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  41.88 
 
 
454 aa  166  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  40.66 
 
 
494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.39 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  31.2 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  33.15 
 
 
337 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.17 
 
 
351 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.87 
 
 
372 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  31.42 
 
 
353 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  38.33 
 
 
456 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 
456 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.5 
 
 
456 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.33 
 
 
456 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  38.33 
 
 
456 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  38.33 
 
 
456 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.33 
 
 
456 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  37.5 
 
 
456 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.82 
 
 
455 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.72 
 
 
368 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.92 
 
 
456 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.74 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  33.89 
 
 
351 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  33.61 
 
 
351 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.19 
 
 
456 aa  155  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  29.88 
 
 
419 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.84 
 
 
418 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.6 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.48 
 
 
455 aa  152  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.02 
 
 
448 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.59 
 
 
456 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.15 
 
 
418 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.15 
 
 
420 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  29.31 
 
 
417 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>