More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1969 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
347 aa  693    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  59.3 
 
 
341 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  56.69 
 
 
339 aa  361  9e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  46.94 
 
 
347 aa  308  8e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  46.22 
 
 
338 aa  306  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.97 
 
 
343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  43.66 
 
 
354 aa  269  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.39 
 
 
357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  43.11 
 
 
336 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.55 
 
 
367 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.65 
 
 
351 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  40.65 
 
 
351 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  37.71 
 
 
355 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.57 
 
 
355 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  40.65 
 
 
351 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  36.6 
 
 
342 aa  229  5e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.83 
 
 
347 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.34 
 
 
383 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.62 
 
 
383 aa  219  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.7 
 
 
418 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.12 
 
 
355 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.7 
 
 
420 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  37.99 
 
 
354 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.77 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.01 
 
 
355 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.7 
 
 
418 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  34.7 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  37.6 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.77 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  37.5 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  36.62 
 
 
383 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.62 
 
 
385 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  37.64 
 
 
337 aa  209  6e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.34 
 
 
392 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.6 
 
 
332 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  37.76 
 
 
348 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.65 
 
 
383 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.68 
 
 
354 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  37.54 
 
 
355 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.12 
 
 
372 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  37.04 
 
 
367 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  35.58 
 
 
353 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  34.64 
 
 
373 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.39 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.32 
 
 
350 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  36.68 
 
 
369 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  33.42 
 
 
375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  33.42 
 
 
377 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.8 
 
 
335 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  36.47 
 
 
354 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  34.81 
 
 
383 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  35.04 
 
 
376 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  35.1 
 
 
367 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  36.87 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.82 
 
 
377 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  39.24 
 
 
417 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.99 
 
 
345 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  33.97 
 
 
388 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.23 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  33.24 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 
396 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  33.15 
 
 
349 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  35.31 
 
 
337 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  43.12 
 
 
419 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  31.25 
 
 
370 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.45 
 
 
353 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.36 
 
 
374 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.7 
 
 
418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  39.7 
 
 
420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  39.7 
 
 
420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.7 
 
 
418 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  32.66 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  39.7 
 
 
420 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  39.7 
 
 
420 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  33.44 
 
 
376 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.86 
 
 
361 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.71 
 
 
345 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  33.53 
 
 
384 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  32.87 
 
 
352 aa  177  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 
345 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  34.45 
 
 
386 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  32.96 
 
 
386 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1818  peptidase M50  36.49 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171111  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  30.45 
 
 
380 aa  175  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  31.98 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  33.89 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  33.89 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  36 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  40.37 
 
 
422 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  32.39 
 
 
386 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.45 
 
 
380 aa  171  1e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  32.09 
 
 
369 aa  169  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.08 
 
 
372 aa  169  7e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  32.08 
 
 
367 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.75 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
381 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.93 
 
 
424 aa  162  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1043  peptidase M50  31.92 
 
 
372 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0249274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  32.29 
 
 
342 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.77 
 
 
368 aa  159  9e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>