More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3836 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
381 aa  762    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  73.49 
 
 
381 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  61.05 
 
 
385 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  59.12 
 
 
383 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  56.99 
 
 
383 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  55.47 
 
 
386 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  56.35 
 
 
383 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  54.33 
 
 
386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  58.27 
 
 
386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.46 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  58.27 
 
 
386 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  58.27 
 
 
386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  56.63 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  59.28 
 
 
384 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  57.18 
 
 
383 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  54.42 
 
 
383 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  52.49 
 
 
373 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  54.08 
 
 
392 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  51.12 
 
 
377 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  49.72 
 
 
375 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.74 
 
 
374 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  48.75 
 
 
379 aa  309  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  46.13 
 
 
379 aa  309  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  48.47 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  45.65 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  47.63 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  43.18 
 
 
361 aa  293  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.94 
 
 
377 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  41.16 
 
 
373 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.04 
 
 
372 aa  258  1e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.06 
 
 
355 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  39.51 
 
 
367 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.29 
 
 
380 aa  253  3e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  35.79 
 
 
380 aa  247  3e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.29 
 
 
367 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.26 
 
 
366 aa  230  3e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  35.66 
 
 
376 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.02 
 
 
353 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  36.67 
 
 
369 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  36.29 
 
 
354 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  36.57 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  39.5 
 
 
356 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  37.19 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  36.57 
 
 
355 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.73 
 
 
355 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  35.71 
 
 
354 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.72 
 
 
444 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.23 
 
 
357 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.64 
 
 
368 aa  199  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  35.34 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.36 
 
 
368 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.4 
 
 
354 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.98 
 
 
368 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.54 
 
 
355 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.89 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  32.44 
 
 
377 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  36.22 
 
 
360 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.06 
 
 
343 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.29 
 
 
480 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.39 
 
 
350 aa  184  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  33.88 
 
 
369 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  43.22 
 
 
494 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  32.6 
 
 
354 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  32.79 
 
 
353 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.16 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  32.88 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  31.09 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  33.61 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.06 
 
 
372 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.56 
 
 
368 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  31.59 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  39.5 
 
 
454 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  34.44 
 
 
341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.05 
 
 
332 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.82 
 
 
456 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  40.08 
 
 
453 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  31.4 
 
 
456 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  29.34 
 
 
417 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  31.11 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.91 
 
 
448 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  37.29 
 
 
461 aa  156  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.98 
 
 
456 aa  156  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  30.37 
 
 
456 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.56 
 
 
456 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  37.18 
 
 
450 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.43 
 
 
450 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  38.56 
 
 
456 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  38.14 
 
 
456 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.86 
 
 
456 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  30.91 
 
 
348 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  38.56 
 
 
456 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  36.86 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.71 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.86 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.91 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.71 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  39.41 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  30.65 
 
 
388 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.86 
 
 
456 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>