More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2850 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  90.34 
 
 		 383 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 		 383 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  85.12 
 
 		 383 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  75.72 
 
 		 383 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  76.24 
 
 		 383 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  74.67 
 
 		 383 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  64.75 
 
 		 383 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  67.31 
 
 		 385 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  61.17 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  57.48 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  57.07 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  58.42 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  58.42 
 
 		 386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  57.89 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  50.96 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  58.16 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  49.46 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  48.81 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  57.46 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  50 
 
 		 374 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  53.59 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  49.44 
 
 		 367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  47.66 
 
 		 379 aa  325  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  47.11 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  47.38 
 
 		 379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  47.11 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  41.58 
 
 		 373 aa  288  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.67 
 
 		 377 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.76 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.66 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.13 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  41.27 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.3 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.26 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  35.26 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  40.61 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.93 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  37.8 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  36.97 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.38 
 
 		 353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  36.13 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.03 
 
 		 355 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  36.34 
 
 		 347 aa  215  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  37.15 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  36.99 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  36.1 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.92 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.77 
 
 		 347 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.57 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.51 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  34.97 
 
 		 354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  36.26 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.23 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.23 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.43 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  32.68 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.39 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  38.29 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.89 
 
 		 350 aa  186  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  38.44 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  41.83 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.44 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.43 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.36 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  30.83 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  33.88 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.19 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.48 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.95 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  33.42 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  29.95 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  34.69 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  33.88 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  32.99 
 
 		 396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1043  peptidase M50  33.25 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0249274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  31.22 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  33.15 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.81 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.39 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1363  membrane-associated zinc metalloprotease  30.62 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  30.57 
 
 		 325 aa  156  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.88 
 
 		 449 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0572  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.22 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.763632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  30.42 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  38.79 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  33.51 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.29 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.79 
 
 		 345 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.8 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  36.32 
 
 		 453 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.29 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  27.94 
 
 		 421 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.73 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>