More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0366 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
367 aa  728    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  42.47 
 
 
383 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  46.35 
 
 
353 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.38 
 
 
383 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.23 
 
 
361 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.36 
 
 
377 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.98 
 
 
383 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.22 
 
 
385 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  44.35 
 
 
367 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.99 
 
 
383 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.38 
 
 
383 aa  262  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.27 
 
 
383 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  39.73 
 
 
383 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  39.61 
 
 
373 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  40.98 
 
 
373 aa  255  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  38.95 
 
 
377 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  38.25 
 
 
375 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.53 
 
 
392 aa  252  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  39.78 
 
 
386 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.46 
 
 
374 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  39.51 
 
 
386 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.34 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  40.05 
 
 
386 aa  239  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  40.05 
 
 
386 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  40.33 
 
 
386 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  40.51 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  39.51 
 
 
381 aa  233  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  38.08 
 
 
379 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.77 
 
 
379 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.9 
 
 
372 aa  211  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.71 
 
 
379 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  34.25 
 
 
380 aa  209  8e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.77 
 
 
366 aa  209  8e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.41 
 
 
355 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  39.71 
 
 
379 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.18 
 
 
380 aa  207  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.24 
 
 
367 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.04 
 
 
347 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  37.36 
 
 
354 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  37.96 
 
 
354 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  34.59 
 
 
355 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  35.73 
 
 
355 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.35 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  35.21 
 
 
369 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  34.27 
 
 
338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  37.15 
 
 
356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.98 
 
 
357 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  33.6 
 
 
376 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  37.92 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  37.65 
 
 
354 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  37.61 
 
 
347 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.17 
 
 
368 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.78 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.73 
 
 
368 aa  189  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.45 
 
 
368 aa  189  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.64 
 
 
355 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  36.49 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.56 
 
 
354 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  35.14 
 
 
354 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  37.54 
 
 
360 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  32.02 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.5 
 
 
343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  34.15 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.53 
 
 
335 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  33.44 
 
 
361 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2406  membrane-associated zinc metalloprotease  33.44 
 
 
361 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738258  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 
377 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.51 
 
 
377 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3268  hypothetical protein  32.37 
 
 
364 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.42 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  30.42 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  30.42 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 
418 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 
418 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 
418 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.94 
 
 
335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 
420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  30.19 
 
 
420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  32 
 
 
352 aa  166  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  30.19 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1363  membrane-associated zinc metalloprotease  33.96 
 
 
369 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  31.71 
 
 
362 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.6 
 
 
351 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  33.42 
 
 
396 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  29.75 
 
 
370 aa  159  6e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.41 
 
 
350 aa  158  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  33.43 
 
 
364 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  36.89 
 
 
351 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  36.6 
 
 
351 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  35.65 
 
 
353 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  35.19 
 
 
341 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  33.02 
 
 
364 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.48 
 
 
418 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1960  membrane-associated zinc metalloprotease  36.36 
 
 
348 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  32.31 
 
 
369 aa  155  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  32.87 
 
 
342 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.17 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  36.23 
 
 
417 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  31.68 
 
 
359 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  31.44 
 
 
348 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>