More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0748 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 		 450 aa  903    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  60.67 
 
 		 451 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  44.44 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  45.15 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  47.99 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  45.25 
 
 		 439 aa  359  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  42.64 
 
 		 443 aa  358  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  44.98 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  47.46 
 
 		 442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  42.2 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  44.32 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  44.87 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  45.32 
 
 		 439 aa  333  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  43.07 
 
 		 455 aa  332  6e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  43.88 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  44.55 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  42.01 
 
 		 447 aa  319  7e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  39.16 
 
 		 453 aa  302  8.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  45.52 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  33.83 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  37.75 
 
 		 403 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  34.65 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  36.72 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  36.06 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  36.69 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  32.68 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  35.81 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  33.7 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  34.36 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  33.78 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  35.33 
 
 		 394 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  32.39 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  32.39 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  32.39 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  33.05 
 
 		 412 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  35.46 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  37.17 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.81 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  29.08 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.21 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.34 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  29.51 
 
 		 352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  29.45 
 
 		 347 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  31.78 
 
 		 438 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  29.31 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  28.68 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  29.59 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.75 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  26.88 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.09 
 
 		 347 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  32.6 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.69 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  29.02 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.97 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  32.76 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.93 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  32.02 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.39 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  33.94 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  29.55 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  36.55 
 
 		 561 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  31.68 
 
 		 354 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  36.55 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.31 
 
 		 558 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  31.4 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  33.62 
 
 		 549 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.02 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.39 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  30 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  33.18 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  26.43 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  31.98 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  31.72 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.65 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  30.36 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  30.8 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  23.66 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  23.04 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  23.55 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.17 
 
 		 480 aa  107  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.23 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.88 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  28.39 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.69 
 
 		 355 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  30.33 
 
 		 379 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.95 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  25.26 
 
 		 369 aa  104  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.5 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.44 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  30.17 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.88 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  24.72 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  31.25 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  29.29 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.72 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  31.67 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  28.99 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.13 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>