More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0829 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  80.61 
 
 
428 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  100 
 
 
428 aa  867    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  80.61 
 
 
428 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  41.45 
 
 
420 aa  342  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  41.45 
 
 
420 aa  342  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  41.45 
 
 
420 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.41 
 
 
418 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  41.45 
 
 
420 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  41.45 
 
 
420 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.41 
 
 
418 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.41 
 
 
418 aa  338  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  41.41 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.18 
 
 
418 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.41 
 
 
418 aa  332  8e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.36 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  41.31 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  40.14 
 
 
419 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  41.18 
 
 
417 aa  308  9e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  38.07 
 
 
420 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.32 
 
 
419 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0923796  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  37.62 
 
 
421 aa  263  4.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0807  membrane-associated Zn-dependent protease 1  37 
 
 
418 aa  256  4e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234706  hitchhiker  0.000000563759 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  35.53 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  31.53 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  30.7 
 
 
376 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.4 
 
 
355 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.43 
 
 
343 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.25 
 
 
448 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.57 
 
 
357 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.84 
 
 
372 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  27.56 
 
 
454 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.33 
 
 
374 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  25.83 
 
 
375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  27.56 
 
 
454 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  32 
 
 
355 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.14 
 
 
450 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  26.07 
 
 
377 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  34.06 
 
 
355 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.92 
 
 
361 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  32.96 
 
 
338 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.11 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  35.96 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  26.17 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  33.21 
 
 
349 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.94 
 
 
355 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.3 
 
 
372 aa  143  6e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  31.87 
 
 
337 aa  143  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.8 
 
 
332 aa  143  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  34.55 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.78 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  25.46 
 
 
386 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  25.38 
 
 
450 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.76 
 
 
385 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  30.31 
 
 
354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.97 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.88 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  26.29 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.92 
 
 
455 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.59 
 
 
450 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  26.78 
 
 
450 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  25.41 
 
 
383 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  36.23 
 
 
370 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.33 
 
 
355 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  32.26 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  29.86 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  26.23 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  30.45 
 
 
354 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  30.8 
 
 
354 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  33.96 
 
 
353 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  24.42 
 
 
386 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  28.98 
 
 
354 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.72 
 
 
377 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.7 
 
 
458 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.08 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.66 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.2 
 
 
368 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  32.1 
 
 
373 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
335 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  26.6 
 
 
456 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  28.99 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  33.05 
 
 
428 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.26 
 
 
367 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.58 
 
 
368 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  33.48 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.42 
 
 
462 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  28.67 
 
 
347 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.58 
 
 
368 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  34.32 
 
 
336 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.72 
 
 
366 aa  124  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  25.42 
 
 
462 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.05 
 
 
446 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  30.26 
 
 
352 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  25.49 
 
 
456 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  29.93 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.66 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.02 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  31.43 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  33.98 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.82 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  33.33 
 
 
369 aa  120  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>