More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2040 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
417 aa  838    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  81.38 
 
 
419 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  58.37 
 
 
420 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  58.13 
 
 
420 aa  494  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  58.13 
 
 
420 aa  494  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  58.37 
 
 
418 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  58.13 
 
 
418 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  58.37 
 
 
418 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  58.13 
 
 
418 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  57.89 
 
 
420 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  57.89 
 
 
420 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  58.37 
 
 
418 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  58.37 
 
 
418 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.57 
 
 
428 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.67 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.67 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.68 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  37.92 
 
 
417 aa  279  8e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  40.38 
 
 
422 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  38.03 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0807  membrane-associated Zn-dependent protease 1  37.53 
 
 
418 aa  270  4e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234706  hitchhiker  0.000000563759 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  37.8 
 
 
428 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.86 
 
 
357 aa  259  6e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.8 
 
 
419 aa  232  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0923796  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  33.89 
 
 
421 aa  225  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2621  membrane-associated zinc metalloprotease  34.6 
 
 
430 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0313354  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  35.37 
 
 
347 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  42.47 
 
 
338 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.69 
 
 
355 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  29.77 
 
 
373 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.24 
 
 
347 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  31.84 
 
 
376 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  31.14 
 
 
450 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.14 
 
 
450 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  31.14 
 
 
450 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  31.14 
 
 
450 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.14 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.49 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.37 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  35.9 
 
 
377 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  30.82 
 
 
451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  30.82 
 
 
451 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  30.82 
 
 
451 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  30.5 
 
 
348 aa  180  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  36.76 
 
 
375 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  29.05 
 
 
439 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.53 
 
 
449 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.13 
 
 
392 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  29.83 
 
 
379 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.31 
 
 
343 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.75 
 
 
385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.55 
 
 
372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.42 
 
 
456 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  37.08 
 
 
354 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.36 
 
 
456 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.07 
 
 
453 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  28.91 
 
 
386 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.72 
 
 
479 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  29.62 
 
 
383 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.68 
 
 
456 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.61 
 
 
454 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.63 
 
 
372 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  28.84 
 
 
383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.95 
 
 
455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  27.82 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.94 
 
 
374 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  27.45 
 
 
459 aa  164  3e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  28.12 
 
 
456 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  29.31 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  27.78 
 
 
456 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  28.02 
 
 
428 aa  162  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  27.78 
 
 
456 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  35.14 
 
 
384 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.21 
 
 
383 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  28.41 
 
 
369 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  29.81 
 
 
354 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  27.35 
 
 
463 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  37.55 
 
 
336 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  36.23 
 
 
367 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.26 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.61 
 
 
383 aa  156  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.21 
 
 
383 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.34 
 
 
383 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  36.93 
 
 
451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  34.42 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.1 
 
 
366 aa  152  8e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  38.1 
 
 
450 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  38.1 
 
 
450 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  38.1 
 
 
450 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  38.1 
 
 
450 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  38.1 
 
 
450 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  30 
 
 
360 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  34.59 
 
 
373 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  38.1 
 
 
450 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.69 
 
 
367 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  36.19 
 
 
367 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  35.82 
 
 
356 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.46 
 
 
383 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
386 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>