More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0692 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
424 aa  860    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0807  membrane-associated Zn-dependent protease 1  51.9 
 
 
418 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234706  hitchhiker  0.000000563759 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  46.35 
 
 
420 aa  368  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  47.84 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0923796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  46.41 
 
 
428 aa  355  1e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  44.29 
 
 
417 aa  353  4e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45 
 
 
420 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.24 
 
 
418 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.24 
 
 
418 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45 
 
 
418 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  45 
 
 
420 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  45 
 
 
420 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45 
 
 
418 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  44.76 
 
 
418 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  44.76 
 
 
420 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  44.76 
 
 
420 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.23 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.23 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  43.36 
 
 
428 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  41.29 
 
 
421 aa  324  2e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  40.95 
 
 
417 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  40.95 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  30.7 
 
 
375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  31.24 
 
 
422 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  29.35 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  29.67 
 
 
377 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  31.09 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.69 
 
 
456 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  30.67 
 
 
451 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.15 
 
 
343 aa  176  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.79 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  28.92 
 
 
454 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.27 
 
 
456 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  28.9 
 
 
376 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.87 
 
 
449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  30.13 
 
 
454 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.6 
 
 
450 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  28.97 
 
 
439 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.96 
 
 
462 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  28.51 
 
 
463 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  29.28 
 
 
469 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.79 
 
 
361 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  28.75 
 
 
462 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.93 
 
 
347 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.93 
 
 
339 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  28.23 
 
 
462 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2621  membrane-associated zinc metalloprotease  27.85 
 
 
430 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0313354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  28.13 
 
 
456 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.27 
 
 
383 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.58 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.94 
 
 
479 aa  153  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  27.67 
 
 
454 aa  153  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.08 
 
 
457 aa  152  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  32 
 
 
370 aa  152  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  32.1 
 
 
347 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  27.39 
 
 
457 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  27.8 
 
 
383 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  27.99 
 
 
456 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.18 
 
 
457 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.18 
 
 
457 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  29.18 
 
 
450 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.79 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.34 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  27.59 
 
 
462 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  37.45 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.94 
 
 
377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  26.6 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  34.36 
 
 
354 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  28.35 
 
 
462 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  30.66 
 
 
373 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  34.75 
 
 
338 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  33.22 
 
 
355 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.56 
 
 
367 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  36.68 
 
 
370 aa  144  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  29.18 
 
 
475 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.72 
 
 
355 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  27.05 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.79 
 
 
383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  38.39 
 
 
336 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  27.6 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  32.48 
 
 
379 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  35.74 
 
 
453 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  30.42 
 
 
453 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  36.36 
 
 
452 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.33 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.88 
 
 
444 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.9 
 
 
455 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.39 
 
 
350 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  27.49 
 
 
462 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.22 
 
 
355 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.35 
 
 
385 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.25 
 
 
353 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  28.21 
 
 
383 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.38 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.63 
 
 
368 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.55 
 
 
332 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0712  peptidase M50  26.94 
 
 
456 aa  136  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41926  hitchhiker  0.0000525349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  27.03 
 
 
438 aa  136  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>