More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1201 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  100 
 
 
432 aa  857    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  51.25 
 
 
438 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  48.75 
 
 
443 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  48.87 
 
 
438 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  48.53 
 
 
442 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  47.95 
 
 
442 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  46.94 
 
 
443 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  47.66 
 
 
447 aa  351  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  44.37 
 
 
450 aa  344  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  48.17 
 
 
439 aa  343  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  46.34 
 
 
455 aa  336  5e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  41.33 
 
 
451 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  50.59 
 
 
438 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  39.15 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  41.18 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  42.43 
 
 
439 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  37.5 
 
 
453 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  37.81 
 
 
440 aa  275  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  38.88 
 
 
454 aa  265  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  37.27 
 
 
393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  34.79 
 
 
394 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  35.06 
 
 
403 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  32.68 
 
 
413 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  34.44 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  30.57 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  32.89 
 
 
412 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  32.81 
 
 
404 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  36.82 
 
 
397 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  34.37 
 
 
412 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  33.11 
 
 
402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  32.3 
 
 
416 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  32.96 
 
 
416 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  31.17 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  31.17 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  31.17 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  31.85 
 
 
413 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  30.6 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.87 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  29.44 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  28.31 
 
 
347 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.74 
 
 
339 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.14 
 
 
347 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  29.12 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  27.62 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  26.36 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.63 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  28.8 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.27 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  29.85 
 
 
363 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.79 
 
 
355 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.17 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  27.03 
 
 
352 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  28.18 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  28.27 
 
 
351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  27.39 
 
 
355 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  27.16 
 
 
355 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  34.5 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  27.73 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.7 
 
 
355 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  28.13 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  27.82 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.53 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  23.94 
 
 
343 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  28.37 
 
 
354 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  30.53 
 
 
438 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  28.25 
 
 
336 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.83 
 
 
418 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.06 
 
 
428 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.06 
 
 
428 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  28.07 
 
 
379 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.01 
 
 
355 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  28.46 
 
 
388 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  30.97 
 
 
438 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.38 
 
 
561 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  28.85 
 
 
453 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  29.79 
 
 
439 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0689  peptidase M50  25.4 
 
 
376 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000148024  hitchhiker  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  32.34 
 
 
430 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  31.38 
 
 
561 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.53 
 
 
354 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  31.38 
 
 
561 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  26.53 
 
 
369 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  25.96 
 
 
446 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  23.81 
 
 
370 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.88 
 
 
450 aa  99.8  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 
385 aa  99.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.33 
 
 
332 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.94 
 
 
383 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.22 
 
 
457 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  25.55 
 
 
383 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.78 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  31.22 
 
 
457 aa  99  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  24.18 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.97 
 
 
454 aa  99  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  28.98 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  24.31 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.99 
 
 
450 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.18 
 
 
418 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>